62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1278 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  100 
 
 		 1465 aa  2970    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  91.23 
 
 		 1687 aa  2576    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  45.76 
 
 		 2142 aa  1036    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  44.94 
 
 		 1193 aa  134  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  37.84 
 
 		 1479 aa  132  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1817  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.1 
 
 		 1787 aa  117  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.29404 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  38.71 
 
 		 1455 aa  102  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  36.61 
 
 		 970 aa  94  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  37.79 
 
 		 693 aa  92.4  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  34.15 
 
 		 1193 aa  87.8  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  32.63 
 
 		 601 aa  87  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  39.04 
 
 		 1295 aa  86.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  35.26 
 
 		 1069 aa  84.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  34.87 
 
 		 1236 aa  81.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  35.26 
 
 		 1206 aa  80.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1842  hyaluronoglucosaminidase domain-containing protein  37.25 
 
 		 248 aa  77  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  24.35 
 
 		 876 aa  75.1  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  30.38 
 
 		 812 aa  74.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4770  wall-associated protein  24.07 
 
 		 1273 aa  72.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000568341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5203  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1067 aa  71.6  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226365  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5171  wall-associated protein  24.1 
 
 		 1277 aa  70.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2851e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4929  hypothetical protein  22.81 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4790  wall-associated protein  22.35 
 
 		 1467 aa  63.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.15 
 
 		 1424 aa  63.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5172  wall-associated protein  23.33 
 
 		 1081 aa  62.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000236947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  31.76 
 
 		 693 aa  60.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  24.46 
 
 		 1392 aa  58.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2581  neutral protease  28.8 
 
 		 884 aa  58.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011855 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2624  bacillolysin  28.77 
 
 		 891 aa  58.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000636329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0040  wall-associated protein  23.29 
 
 		 1476 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218443  hitchhiker  4.78109e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5208  wall-associated protein  21.08 
 
 		 1068 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5221  wall-associated protein  21.08 
 
 		 1270 aa  57.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.632679  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4888  wall-associated protein precursor  22.85 
 
 		 1475 aa  57  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2335  S-layer domain-containing protein  24.16 
 
 		 869 aa  55.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0205694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  33.73 
 
 		 2638 aa  54.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1695  S-layer domain protein  23.92 
 
 		 735 aa  53.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000200571 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1808  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  27.2 
 
 		 413 aa  52  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4248  hypothetical protein  24.18 
 
 		 824 aa  52  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0627  hypothetical protein  25.19 
 
 		 506 aa  51.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.300902 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2571  neutral protease A, bacillolysin  35.56 
 
 		 891 aa  50.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000442231  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  34.86 
 
 		 197 aa  50.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2348  bacillolysin (neutral protease)  36.05 
 
 		 890 aa  51.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00113983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2310  bacillolysin  33.33 
 
 		 886 aa  50.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105645  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0647  chitinase-related protein  40 
 
 		 105 aa  50.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4574  hypothetical protein  26.6 
 
 		 827 aa  50.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2393  thermolysin metallopeptidase  35.56 
 
 		 530 aa  49.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  32.69 
 
 		 2294 aa  49.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  30.85 
 
 		 727 aa  48.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  23.11 
 
 		 749 aa  47.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2789  bacillolysin  38.75 
 
 		 893 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000716183  hitchhiker  0.000000152737 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  32.18 
 
 		 699 aa  47  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1122  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  47  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0136739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1144  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  47  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0791111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2532  hypothetical protein  24.51 
 
 		 770 aa  46.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  38.55 
 
 		 498 aa  47  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  28.47 
 
 		 1088 aa  47  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2001  putative lipoprotein  22.28 
 
 		 679 aa  46.2  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.629311  normal  0.117944 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  27.66 
 
 		 1052 aa  45.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09730  hypothetical protein  26.94 
 
 		 464 aa  45.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.50179  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  37.5 
 
 		 565 aa  45.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  24.09 
 
 		 591 aa  45.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  35 
 
 		 356 aa  45.1  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0229946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>