51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1259 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1259  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  603  1e-172  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.61457e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1457  hypothetical protein  88.52 
 
 
322 aa  538  1e-152  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000494254  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  58.31 
 
 
851 aa  336  4e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  57.63 
 
 
851 aa  333  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  31.95 
 
 
840 aa  137  3e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  31.95 
 
 
840 aa  137  3e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  28.03 
 
 
847 aa  114  2e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  29.15 
 
 
861 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  26.83 
 
 
859 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.41179e-10 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  27.02 
 
 
861 aa  99  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  27.02 
 
 
861 aa  99  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  27.02 
 
 
861 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  27.02 
 
 
861 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  27.02 
 
 
861 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  27.02 
 
 
861 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  27.02 
 
 
861 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88659e-07 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  27.24 
 
 
859 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  30.04 
 
 
840 aa  96.7  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  27.18 
 
 
861 aa  94  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  26.67 
 
 
851 aa  90.1  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  28.24 
 
 
858 aa  89.4  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  21.9 
 
 
844 aa  58.2  2e-07  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  23.77 
 
 
320 aa  56.2  6e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  21.96 
 
 
314 aa  56.6  6e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  25.85 
 
 
813 aa  54.7  2e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  19.34 
 
 
850 aa  53.9  3e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  21.18 
 
 
850 aa  53.1  6e-06  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5424  hypothetical protein  25.21 
 
 
320 aa  51.2  2e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06897  hitchhiker  0.00740076 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  20.08 
 
 
313 aa  51.6  2e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  19.69 
 
 
850 aa  49.7  6e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.74946e-06 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  24.73 
 
 
311 aa  49.3  8e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  22.43 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  21.83 
 
 
863 aa  46.2  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  21.83 
 
 
863 aa  46.2  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  22.86 
 
 
392 aa  46.2  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  6.83959e-15 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  26.36 
 
 
362 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  25.23 
 
 
392 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  29.81 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  28.04 
 
 
866 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  27.37 
 
 
339 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  28.57 
 
 
368 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  27.94 
 
 
783 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  28.57 
 
 
356 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  21.13 
 
 
875 aa  43.1  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  34.57 
 
 
880 aa  43.1  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  27.88 
 
 
345 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  29.59 
 
 
343 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  24.19 
 
 
340 aa  42.7  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  29.59 
 
 
343 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5004  hypothetical protein  20 
 
 
317 aa  42.7  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5838  hypothetical protein  25.49 
 
 
378 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28738  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>