More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1225 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  98.49 
 
 		 398 aa  807    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  100 
 
 		 398 aa  818    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  46.56 
 
 		 390 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  44.22 
 
 		 415 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  44.33 
 
 		 399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  42.6 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  43.33 
 
 		 401 aa  316  4e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  42.13 
 
 		 390 aa  316  5e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  40.76 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  41.16 
 
 		 400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  41.09 
 
 		 405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  41.71 
 
 		 391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  40.36 
 
 		 403 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  40.31 
 
 		 391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  40.36 
 
 		 403 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  43.46 
 
 		 400 aa  302  7.000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  40.53 
 
 		 405 aa  301  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  38.05 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  40.58 
 
 		 392 aa  300  4e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  40.21 
 
 		 394 aa  300  4e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  39.42 
 
 		 405 aa  298  8e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  41.62 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  40.1 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  39.18 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  42.05 
 
 		 380 aa  292  7e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  39.1 
 
 		 402 aa  292  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  40 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  39.32 
 
 		 480 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  38.5 
 
 		 402 aa  290  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  37.53 
 
 		 405 aa  289  6e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  37.79 
 
 		 404 aa  288  9e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  36.92 
 
 		 389 aa  285  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  38.5 
 
 		 397 aa  285  9e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  38.54 
 
 		 396 aa  285  9e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  39.21 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  40.41 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1675  amidohydrolase  37.4 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  37.69 
 
 		 398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  40.05 
 
 		 395 aa  283  5.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  36.93 
 
 		 400 aa  281  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  38.71 
 
 		 408 aa  281  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  40.74 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  36.32 
 
 		 401 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  36.32 
 
 		 401 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  36.27 
 
 		 407 aa  280  3e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  40.54 
 
 		 396 aa  279  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  36.82 
 
 		 425 aa  278  9e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  38.85 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  37.31 
 
 		 408 aa  278  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  38.46 
 
 		 388 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0708  carboxypeptidase  38.46 
 
 		 396 aa  276  4e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1065  carboxypeptidase  38.46 
 
 		 396 aa  276  4e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.094231  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  36.76 
 
 		 387 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  38.7 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  36.5 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0634  carboxypeptidase  38.46 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.062973  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  38.92 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  39.32 
 
 		 435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1761  amidohydrolase  42.64 
 
 		 394 aa  273  3e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  37.22 
 
 		 391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  37.3 
 
 		 404 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  37.18 
 
 		 399 aa  272  8.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  35.5 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  38.13 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0269  amidohydrolase  36.51 
 
 		 423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  37.5 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  35.54 
 
 		 424 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  37.7 
 
 		 388 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  36.25 
 
 		 401 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  35.99 
 
 		 387 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  38.92 
 
 		 385 aa  270  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  37.47 
 
 		 400 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  38.92 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  38.31 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0591  amidohydrolase  40.68 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  38.05 
 
 		 410 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  38.64 
 
 		 396 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  36.64 
 
 		 409 aa  268  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  36.75 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  38.36 
 
 		 393 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  36.14 
 
 		 396 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  37.63 
 
 		 389 aa  266  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  35.98 
 
 		 423 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  36.39 
 
 		 405 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  35.89 
 
 		 396 aa  265  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  38.18 
 
 		 404 aa  265  8e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1067  hippurate hydrolase  39.09 
 
 		 383 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.956056  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  36.99 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  37.76 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  37.98 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  36.32 
 
 		 407 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  38.52 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  38.24 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  35.66 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  36.62 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  37.59 
 
 		 465 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1004  hippurate hydrolase  39.34 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  34.88 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  37.76 
 
 		 399 aa  263  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  36.02 
 
 		 389 aa  263  4.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>