143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1216 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1216  hypothetical protein  100 
 
 
662 aa  1376  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.364904  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2132  hypothetical protein  59.46 
 
 
620 aa  758  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00115691  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1407  hypothetical protein  99.09 
 
 
662 aa  1365  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00374356  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3616  hypothetical protein  58.14 
 
 
685 aa  788  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11120  Fe-S oxidoreductase  58.03 
 
 
718 aa  766  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390145  normal  0.0549005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3126  hypothetical protein  59.78 
 
 
642 aa  791  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0311249  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2328  Radical SAM domain protein  53.3 
 
 
666 aa  742  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1094  hypothetical protein  58.87 
 
 
639 aa  793  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0145194  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0603  hypothetical protein  56.28 
 
 
683 aa  785  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2444  radical SAM domain-containing protein  47.83 
 
 
640 aa  628  1e-179  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1858  radical SAM domain-containing protein  50.58 
 
 
600 aa  628  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1776  hypothetical protein  48.61 
 
 
622 aa  613  1e-174  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1972  Radical SAM domain protein  46.95 
 
 
621 aa  596  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270598  normal  0.360161 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1538  radical SAM domain-containing protein  49.75 
 
 
598 aa  585  1e-166  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.415289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0609  radical SAM family protein  47.41 
 
 
603 aa  572  1e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00147953  hitchhiker  0.00191958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0915  Radical SAM domain protein  45.96 
 
 
599 aa  566  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1409  Radical SAM domain protein  46.15 
 
 
614 aa  567  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0556  radical SAM domain-containing protein  42.59 
 
 
623 aa  561  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.837617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3346  Radical SAM domain protein  45.89 
 
 
598 aa  561  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0576598 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0293  hypothetical protein  43.01 
 
 
710 aa  551  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6215  radical SAM domain-containing protein  44.43 
 
 
679 aa  551  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.310596 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0582  radical SAM domain-containing protein  46.91 
 
 
567 aa  548  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7218  hypothetical protein  44.08 
 
 
674 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0596  radical SAM domain-containing protein  46.91 
 
 
567 aa  548  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.578273  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02838  hypothetical protein  40.53 
 
 
739 aa  548  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3484  hypothetical protein  40.53 
 
 
739 aa  547  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2873  radical SAM domain-containing protein  46.66 
 
 
605 aa  547  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1052  radical SAM domain-containing protein  45.55 
 
 
605 aa  546  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.173598  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0684  Radical SAM domain protein  40.53 
 
 
739 aa  547  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4610  radical SAM domain-containing protein  44.2 
 
 
688 aa  547  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0159872 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0681  hypothetical protein  40.53 
 
 
739 aa  547  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4327  hypothetical protein  40.53 
 
 
739 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3519  hypothetical protein  43.63 
 
 
723 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.115115  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3349  hypothetical protein  43.63 
 
 
723 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02888  hypothetical protein  40.53 
 
 
739 aa  548  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5075  Radical SAM domain protein  44.05 
 
 
688 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.369209 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0066  radical SAM family protein  46.04 
 
 
648 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3352  hypothetical protein  43.63 
 
 
723 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3194  hypothetical protein  40.53 
 
 
739 aa  547  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3418  hypothetical protein  43.63 
 
 
723 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3424  hypothetical protein  43.63 
 
 
723 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518229  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3300  hypothetical protein  43.01 
 
 
739 aa  545  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0672097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4193  Radical SAM domain protein  43.65 
 
 
678 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0942  radical SAM domain-containing protein  44.03 
 
 
679 aa  545  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3451  hypothetical protein  40.39 
 
 
739 aa  544  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0072  Radical SAM domain protein  45.87 
 
 
648 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0689  radical SAM family protein  44.34 
 
 
671 aa  541  1e-152  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1515  Radical SAM domain protein  42.66 
 
 
758 aa  540  1e-152  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0572332  hitchhiker  0.00245581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0746  Radical SAM domain protein  44.09 
 
 
677 aa  540  1e-152  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1897  Fe-S oxidoreductase  42.47 
 
 
625 aa  541  1e-152  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17655e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0084  Radical SAM domain protein  46.04 
 
 
648 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.028481  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0068  radical SAM domain-containing protein  45.38 
 
 
658 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.514908  normal  0.0285773 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1632  extracellular solute-binding protein  47.3 
 
 
612 aa  538  1e-151  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1103  radical SAM domain-containing protein  43.47 
 
 
673 aa  536  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204136  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2003  radical SAM family protein  42.28 
 
 
707 aa  537  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1663  Radical SAM domain protein  40 
 
 
745 aa  534  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01783  hypothetical protein  40.79 
 
 
791 aa  533  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3424  hypothetical protein  43.01 
 
 
724 aa  534  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0585  hypothetical protein  42.59 
 
 
787 aa  529  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1996  radical SAM family protein  42.71 
 
 
740 aa  529  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578599  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4234  hypothetical protein  42.75 
 
 
721 aa  529  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.577109 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0666  hypothetical protein  39.92 
 
 
775 aa  529  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02777  hypothetical protein  39.24 
 
 
787 aa  529  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0856  hypothetical protein  41.78 
 
 
790 aa  527  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.109884  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1314  hypothetical protein  39.11 
 
 
789 aa  526  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1109  Radical SAM domain protein  45.83 
 
 
571 aa  526  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.890323  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3187  Radical SAM domain protein  43.11 
 
 
607 aa  526  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00436822  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003066  hypothetical protein  39.26 
 
 
781 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0262  radical SAM domain-containing protein  47.8 
 
 
568 aa  523  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.282617  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1364  radical SAM domain-containing protein  37.53 
 
 
755 aa  524  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0540  hypothetical protein  43.14 
 
 
767 aa  521  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212733  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07700  hypothetical protein  41.97 
 
 
757 aa  518  1e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.568115  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1417  Fe-S oxidoreductase, radical SAM domain protein  44.39 
 
 
583 aa  515  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4750  hypothetical protein  39.16 
 
 
766 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000182579 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4218  hypothetical protein  39.27 
 
 
774 aa  512  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4872  hypothetical protein  39.16 
 
 
766 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.783093  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3349  hypothetical protein  40.57 
 
 
806 aa  508  1e-142  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2297  Elongator protein 3/MiaB/NifB  44.54 
 
 
620 aa  502  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2271  radical SAM domain-containing protein  40.52 
 
 
770 aa  504  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1403  Radical SAM domain protein  41.79 
 
 
630 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.59751 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0281  Radical SAM domain protein  43.58 
 
 
589 aa  503  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4928  hypothetical protein  41.61 
 
 
736 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.95754e-07 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4663  hypothetical protein  41.77 
 
 
737 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4160  hypothetical protein  38.72 
 
 
687 aa  496  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3431  radical SAM-like  39.12 
 
 
784 aa  496  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1188  Radical SAM domain protein  43.56 
 
 
740 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4928  radical SAM domain protein  39.33 
 
 
771 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0587  hypothetical protein  39.33 
 
 
769 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282021  normal  0.175321 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0407  radical SAM domain-containing protein  43.16 
 
 
595 aa  477  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0934  hypothetical protein  40.6 
 
 
634 aa  474  1e-132  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.157188 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1506  radical SAM domain-containing protein  44.85 
 
 
554 aa  465  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1013  Radical SAM domain protein  39.93 
 
 
607 aa  452  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  4.09081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1359  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38 
 
 
646 aa  445  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0819  radical SAM domain-containing protein  38.05 
 
 
680 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2985  Radical SAM domain protein  32.39 
 
 
771 aa  401  1e-110  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.5382 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2121  Radical SAM domain protein  35.81 
 
 
746 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0945  hypothetical protein  48.36 
 
 
657 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2898  radical SAM family protein  44.01 
 
 
724 aa  350  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.041487 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3670  hypothetical protein  40 
 
 
781 aa  344  3e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0275  hypothetical protein  40 
 
 
781 aa  344  3e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>