107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1209 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1397  vanW-related protein  98.1 
 
 		 420 aa  828    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000158977  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1209  vancomycin b-type resistance protein vanW, putative  100 
 
 		 420 aa  840    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000880463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  32.95 
 
 		 458 aa  193  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  28.47 
 
 		 491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  27.13 
 
 		 481 aa  166  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  32.05 
 
 		 520 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  31.75 
 
 		 518 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  28.6 
 
 		 439 aa  156  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  29.35 
 
 		 467 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1436  VanW family protein  27.99 
 
 		 474 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0672  hypothetical protein  28.01 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0571  hypothetical protein  28.27 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0604  hypothetical protein  28.27 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0513  vancomycin b-type resistance protein  28.01 
 
 		 420 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0660  hypothetical protein  28.01 
 
 		 420 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50262e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0515  vancomycin b-type resistance protein  27.75 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0731  hypothetical protein  27.75 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0642  vancomycin B-type resistance protein VanW  27.56 
 
 		 420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  27.8 
 
 		 456 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0522  VanW family protein  26.85 
 
 		 417 aa  137  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4696  vancomycin B-type resistance protein VanW  27.23 
 
 		 420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000301625 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  27.46 
 
 		 491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2386  VanW  33.75 
 
 		 569 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0518  VanW family protein  27.37 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4437  VanW family protein  28.27 
 
 		 503 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2263  VanW family protein  28.85 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431466 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1493  VanW family protein  26.75 
 
 		 520 aa  120  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863101 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0147  VanW family protein  39.19 
 
 		 319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3641  putative lipoprotein  34.31 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1676  putative lipoprotein  34.31 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0114871  decreased coverage  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3327  putative lipoprotein  34.31 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3291  lipoprotein  34.31 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.012504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3588  putative lipoprotein  34.31 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.54706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3542  putative lipoprotein  34.31 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81276e-32 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3560  VanW family protein  28.19 
 
 		 435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101582  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3243  lipoprotein  34.31 
 
 		 303 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00100446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  25.57 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2734  VanW  34.6 
 
 		 279 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3548  VanW-related protein  36.04 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0578688  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0472  hypothetical protein  24.8 
 
 		 510 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000143149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3551  putative lipoprotein  36.04 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3236  VanW family protein  34.11 
 
 		 303 aa  106  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166746  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1452  VanW family protein  42.54 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88765  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2217  VanW family protein  34.31 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  25.3 
 
 		 686 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3060  VanW family protein  37.84 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  41.18 
 
 		 600 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0423  VanW family protein  33.33 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3975  VanW family protein  35.46 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000476767  unclonable  0.000000000108609 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1358  hypothetical protein  35.17 
 
 		 319 aa  96.7  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  26.27 
 
 		 633 aa  96.3  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0694  copper amine oxidase-like  36.25 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351561  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1251  hypothetical protein  29.05 
 
 		 591 aa  93.2  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2042  VanW family protein  35.56 
 
 		 366 aa  90.9  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1227  VanW family protein  29.38 
 
 		 253 aa  90.1  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0907  hypothetical protein  40.44 
 
 		 219 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1302  VanW family protein  30.14 
 
 		 248 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0398  VanW family protein  36.84 
 
 		 620 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151032  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  25.4 
 
 		 636 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3002  VanW family protein  26.01 
 
 		 591 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3683  VanW family protein  37.09 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206654  hitchhiker  0.000681281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  25.91 
 
 		 636 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  33.85 
 
 		 580 aa  87.4  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0204  VanW family protein  30.67 
 
 		 604 aa  86.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0198  VanW family protein  28.78 
 
 		 393 aa  86.3  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1161  VanW family protein  32.52 
 
 		 580 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5187  VanW family protein  27.91 
 
 		 576 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0186  VanW family protein  28.69 
 
 		 608 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  24.79 
 
 		 675 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1823  hypothetical protein  26.36 
 
 		 569 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  26.16 
 
 		 582 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  26.02 
 
 		 781 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  22.85 
 
 		 670 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3234  VanW family protein  25.56 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8063  vancomycin resistance protein- like protein  23.44 
 
 		 690 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4059  VanW family protein  28.72 
 
 		 642 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.40506  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4452  VanW family protein  24.51 
 
 		 559 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1577  VanW family protein  29.95 
 
 		 738 aa  78.2  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.272473 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1126  VanW family protein  34.85 
 
 		 772 aa  77.4  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  22.98 
 
 		 677 aa  77.4  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4909  VanW family protein  29.14 
 
 		 633 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  28.27 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28220  uncharacterized vancomycin resistance protein  29.39 
 
 		 550 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0965  VanW family protein  33.58 
 
 		 776 aa  73.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.964336  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1933  VanW family protein  25.98 
 
 		 567 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1593  VanW  30.14 
 
 		 565 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0075  VanW family protein  35.83 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1425  VanW family protein  23.76 
 
 		 617 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0991  VanW family protein  30.83 
 
 		 1016 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19490  uncharacterized vancomycin resistance protein  24.88 
 
 		 682 aa  68.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0459635  decreased coverage  0.00355972 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26060  uncharacterized vancomycin resistance protein  31.54 
 
 		 765 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  34.81 
 
 		 748 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0964  hypothetical protein  36.36 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6965  VanW family protein  34.88 
 
 		 892 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0832  VanW family protein  32 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1613  VanW family protein  22.37 
 
 		 594 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0632012  normal  0.156067 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0796  VanW family protein  31.34 
 
 		 847 aa  61.2  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.823779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0758  VanW family protein  24.58 
 
 		 1355 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.115824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  26.99 
 
 		 579 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2332  VanW  37.8 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>