57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1189 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  99.34 
 
 
340 aa  317  5e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  98.68 
 
 
340 aa  315  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  98.68 
 
 
340 aa  315  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  98.68 
 
 
340 aa  315  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  98.68 
 
 
340 aa  315  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  98.68 
 
 
340 aa  315  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  98.68 
 
 
253 aa  314  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1189  ISCpe7, transposase  100 
 
 
152 aa  314  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238866  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  98.03 
 
 
340 aa  313  7e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  5.45032e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  98.03 
 
 
340 aa  313  7e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0929  ISCpe7, transposase  97.37 
 
 
186 aa  307  3e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0298408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0635  ISCpe7, transposase  97.37 
 
 
186 aa  306  7e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  46.88 
 
 
353 aa  145  1e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  46.88 
 
 
353 aa  145  1e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  46.88 
 
 
353 aa  145  1e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  46.88 
 
 
353 aa  145  1e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0243  Integrase catalytic region  45 
 
 
353 aa  143  8e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0037  Integrase catalytic region  45 
 
 
353 aa  143  8e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1065  Integrase catalytic region  45 
 
 
353 aa  143  8e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.106559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1912  Integrase catalytic region  45 
 
 
353 aa  143  8e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2179  Integrase catalytic region  45 
 
 
353 aa  143  8e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  5.21095e-09  hitchhiker  1.88153e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2409  Integrase catalytic region  45 
 
 
353 aa  143  8e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2243  Integrase catalytic region  45 
 
 
353 aa  143  8e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.781166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  44.74 
 
 
343 aa  139  1e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.47635e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0030  insertion element protein  35.26 
 
 
312 aa  72  3e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  8.55614e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0903  ISCpe7, transposase  35.26 
 
 
312 aa  71.6  3e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  5.97662e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0799  ISCpe7, transposase  35.26 
 
 
312 aa  71.6  3e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1361  ISCpe7, transposase  35.26 
 
 
312 aa  71.6  3e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0203024  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0556  ISCpe7, transposase  35.26 
 
 
312 aa  71.6  3e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1581  ISCpe7, transposase  35.26 
 
 
312 aa  71.6  3e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0115  hypothetical protein  35.26 
 
 
261 aa  72  3e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  1.60092e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1164  ISCpe7, transposase  35.26 
 
 
312 aa  71.6  3e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1196  ISCpe7, transposase  35.26 
 
 
312 aa  71.2  4e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0078  ISCpe7, transposase  35.26 
 
 
312 aa  71.2  4e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.516266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0337  ISCpe7, transposase  35.26 
 
 
312 aa  71.2  4e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.500965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0422  insertion element protein  35.26 
 
 
312 aa  71.6  4e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0386  hypothetical protein  35.26 
 
 
261 aa  71.2  4e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0727  insertion element protein  35.26 
 
 
312 aa  71.6  4e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0509  ISCpe7, transposase  34.62 
 
 
312 aa  71.2  5e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1574  ISCpe7, transposase  34.62 
 
 
312 aa  71.2  5e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0315  ISCpe7, transposase  30.92 
 
 
316 aa  63.2  1e-09  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00611234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1078  ISCpe7, transposase  30.92 
 
 
316 aa  63.2  1e-09  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  1.01857e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0035  ISCpe7, transposase  30.92 
 
 
316 aa  63.2  1e-09  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.800546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1412  ISCpe7, transposase  30.92 
 
 
316 aa  63.2  1e-09  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  6.18416e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1261  ISCpe7, transposase  30.92 
 
 
316 aa  63.2  1e-09  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  1.18886e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0745  ISCpe7, transposase  30.92 
 
 
316 aa  63.2  1e-09  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  8.15737e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2900  hypothetical protein  33.77 
 
 
108 aa  50.8  6e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0226178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0319  transposase  23.12 
 
 
470 aa  50.4  9e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1444  putative transposase  47.5 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2050  transposase  23.12 
 
 
478 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  9.63714e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0694  transposase  23.12 
 
 
478 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.08331e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0539  transposase  23.12 
 
 
478 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  5.12999e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0265  IS1 transposase  50 
 
 
233 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.878281 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0700  IS1 transposase  50 
 
 
233 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1525  IS1 transposase  50 
 
 
233 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1938  IS1 transposase  50 
 
 
233 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0313  CRISPR-associated RAMP Cmr1 family protein  37.21 
 
 
406 aa  40.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>