More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1103 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1103  pyruvate kinase barrel domain-containing protein  100 
 
 
360 aa  717  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00167331  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1281  pyruvate kinase barrel domain-containing protein  98.33 
 
 
360 aa  707  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000848085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2321  pyruvate kinase  32.83 
 
 
496 aa  164  2e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238455  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  32.05 
 
 
585 aa  164  2e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  32.34 
 
 
585 aa  163  5e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  32.34 
 
 
585 aa  163  5e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  32.05 
 
 
585 aa  162  8e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  32.05 
 
 
585 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  32.05 
 
 
585 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  32.05 
 
 
585 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  31.85 
 
 
585 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  32.05 
 
 
585 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  32.05 
 
 
585 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  32.05 
 
 
585 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  31.19 
 
 
474 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  29.39 
 
 
474 aa  156  5e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  30.77 
 
 
480 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.77516e-10  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03130  pyruvate kinase  32.01 
 
 
476 aa  154  3e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0435027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3360  pyruvate kinase  31.5 
 
 
352 aa  152  6e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.100126  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  28.99 
 
 
479 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3123  pyruvate kinase  30.25 
 
 
356 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3352  pyruvate kinase  31.31 
 
 
352 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.270163  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  33.03 
 
 
596 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  28.19 
 
 
476 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3030  pyruvate kinase  31.76 
 
 
352 aa  149  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3357  pyruvate kinase  31.69 
 
 
359 aa  148  1e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3382  pyruvate kinase  31.69 
 
 
352 aa  148  1e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3136  pyruvate kinase  31.69 
 
 
352 aa  148  1e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.188208  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  27.41 
 
 
476 aa  147  2e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1896  pyruvate kinase  30.89 
 
 
352 aa  147  2e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4063  pyruvate kinase  31.44 
 
 
488 aa  148  2e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910781  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  29.41 
 
 
472 aa  148  2e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  29.41 
 
 
472 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  8.99763e-06  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3335  pyruvate kinase  30.89 
 
 
352 aa  147  4e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  28.24 
 
 
474 aa  146  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  30.86 
 
 
480 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.0448e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3056  pyruvate kinase  30.25 
 
 
373 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327926  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  29.79 
 
 
471 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  33.24 
 
 
585 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.0731e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  28.44 
 
 
482 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  29.18 
 
 
474 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  27.03 
 
 
481 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  26.97 
 
 
482 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  28.66 
 
 
505 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  28.86 
 
 
588 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  31.31 
 
 
476 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  27.16 
 
 
477 aa  143  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  30.35 
 
 
578 aa  142  1e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4367  pyruvate kinase  29.43 
 
 
489 aa  141  2e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  28.26 
 
 
476 aa  140  2e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  28.18 
 
 
476 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  28.66 
 
 
476 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1063  pyruvate kinase  31.1 
 
 
488 aa  140  4e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.175798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4390  pyruvate kinase  29.13 
 
 
489 aa  139  5e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  28.08 
 
 
471 aa  140  5e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  34.43 
 
 
474 aa  139  5e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  30.41 
 
 
585 aa  140  5e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  34.43 
 
 
474 aa  140  5e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  30.41 
 
 
585 aa  140  5e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  28.83 
 
 
478 aa  139  5e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  27.59 
 
 
484 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  30.53 
 
 
480 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  30.55 
 
 
577 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4234  pyruvate kinase  29.43 
 
 
489 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  31.61 
 
 
597 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  27.71 
 
 
586 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  28.25 
 
 
481 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  30.72 
 
 
476 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  30.94 
 
 
470 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  28.95 
 
 
585 aa  138  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05210  Pyruvate kinase (PK)(EC 2.7.1.40) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22360]  30.15 
 
 
526 aa  137  3e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  31.21 
 
 
596 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1141  pyruvate kinase  31.86 
 
 
477 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  31.72 
 
 
483 aa  136  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  27.74 
 
 
478 aa  136  6e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  30.12 
 
 
472 aa  136  6e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  28.18 
 
 
582 aa  136  6e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  31.21 
 
 
596 aa  136  7e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1420  hypothetical protein  30.54 
 
 
461 aa  135  1e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0177  pyruvate kinase  30.09 
 
 
474 aa  135  1e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  29.1 
 
 
477 aa  135  1e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  29.57 
 
 
580 aa  135  1e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  29.68 
 
 
487 aa  135  1e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1432  pyruvate kinase  29.18 
 
 
569 aa  134  2e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0882  pyruvate kinase  26.78 
 
 
589 aa  134  2e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.441073  hitchhiker  2.01084e-13 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  25.45 
 
 
477 aa  134  2e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  28.44 
 
 
479 aa  134  2e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  1.34054e-09 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  27.96 
 
 
481 aa  135  2e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  33.54 
 
 
580 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20690  pyruvate kinase  29 
 
 
472 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0604306  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0844  pyruvate kinase  27.27 
 
 
585 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0990  pyruvate kinase  29.05 
 
 
492 aa  133  4e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00681712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  26.69 
 
 
485 aa  133  4e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  30.11 
 
 
471 aa  133  4e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  29.94 
 
 
590 aa  133  4e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  28.2 
 
 
481 aa  133  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  25.67 
 
 
484 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  29.03 
 
 
491 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  30.84 
 
 
480 aa  132  7e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  25.67 
 
 
484 aa  132  7e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>