More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1091 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  100 
 
 
878 aa  1790  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  98.63 
 
 
878 aa  1770  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  45.06 
 
 
884 aa  736  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  65.25 
 
 
399 aa  569  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  65 
 
 
399 aa  567  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  54.5 
 
 
400 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  47.76 
 
 
508 aa  435  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  46.87 
 
 
397 aa  389  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.25791e-05  hitchhiker  6.1463e-07 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  47.29 
 
 
407 aa  368  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  47.25 
 
 
425 aa  364  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  46.55 
 
 
407 aa  362  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  47 
 
 
407 aa  362  2e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  46.1 
 
 
407 aa  357  4e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  46.75 
 
 
407 aa  352  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  44.61 
 
 
407 aa  352  2e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  42.71 
 
 
396 aa  332  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.65819e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  41.18 
 
 
395 aa  325  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.74578e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  42.03 
 
 
423 aa  325  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  42.46 
 
 
395 aa  319  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  42.71 
 
 
395 aa  319  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  39.9 
 
 
431 aa  309  2e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  38.11 
 
 
421 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  37.68 
 
 
409 aa  293  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.47 
 
 
397 aa  280  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  34.62 
 
 
405 aa  264  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  35.32 
 
 
397 aa  259  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.36277e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  36.59 
 
 
402 aa  259  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2460  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase or nitrite reductase  33.04 
 
 
501 aa  258  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000440664  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  36.75 
 
 
392 aa  254  4e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.79 
 
 
575 aa  251  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  35.88 
 
 
399 aa  248  5e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  7.05459e-05 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  33.67 
 
 
401 aa  245  3e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  34.51 
 
 
392 aa  243  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  34.32 
 
 
393 aa  243  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1498  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.01 
 
 
393 aa  241  4e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  34.71 
 
 
405 aa  239  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  33.67 
 
 
396 aa  239  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.11538e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  35.61 
 
 
387 aa  239  2e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.16 
 
 
498 aa  238  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 
398 aa  238  4e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.33 
 
 
575 aa  236  1e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.33 
 
 
575 aa  236  1e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  34.89 
 
 
402 aa  234  4e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  34.75 
 
 
401 aa  234  5e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  33.84 
 
 
387 aa  233  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  34.4 
 
 
402 aa  232  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  33.5 
 
 
418 aa  232  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.36 
 
 
493 aa  231  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.64 
 
 
504 aa  231  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  34.91 
 
 
397 aa  231  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  34.6 
 
 
387 aa  231  5e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.81 
 
 
479 aa  230  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  33.93 
 
 
387 aa  230  9e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  31.81 
 
 
479 aa  230  9e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.73 
 
 
479 aa  230  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.35155e-06 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.73 
 
 
479 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1920  beta-lactamase domain protein  32.45 
 
 
393 aa  229  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.45 
 
 
479 aa  230  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  34.09 
 
 
391 aa  229  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.16658e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.6 
 
 
479 aa  229  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.92 
 
 
500 aa  229  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.6 
 
 
479 aa  229  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  31.6 
 
 
479 aa  229  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.52 
 
 
479 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  36.88 
 
 
406 aa  228  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.6 
 
 
479 aa  228  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.6 
 
 
479 aa  228  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  33.08 
 
 
397 aa  228  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  33.17 
 
 
396 aa  228  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.47 
 
 
479 aa  228  5e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 
384 aa  227  6e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.46 
 
 
479 aa  227  8e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.26 
 
 
503 aa  226  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.52 
 
 
479 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  36.63 
 
 
406 aa  226  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.97 
 
 
394 aa  226  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  3.51493e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.3 
 
 
576 aa  225  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.69 
 
 
505 aa  225  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2180  flavoprotein  30.18 
 
 
582 aa  223  1e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0320  beta-lactamase domain-containing protein  34.03 
 
 
388 aa  223  1e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  32.83 
 
 
575 aa  223  1e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.5 
 
 
396 aa  223  2e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.67 
 
 
485 aa  222  2e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.76 
 
 
576 aa  222  2e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.79 
 
 
482 aa  222  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  31.89 
 
 
396 aa  221  4e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.92 
 
 
494 aa  221  4e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  32.11 
 
 
404 aa  221  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1376  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
591 aa  220  7e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2358  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.08 
 
 
422 aa  220  8e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.91843e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.25 
 
 
499 aa  219  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  34.92 
 
 
387 aa  220  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.16 
 
 
520 aa  220  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  33.17 
 
 
404 aa  219  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  8.71777e-05 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  31.62 
 
 
571 aa  219  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.46 
 
 
575 aa  218  3e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.36 
 
 
422 aa  218  3e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00571  flavoprotein  32.85 
 
 
592 aa  217  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2530  flavoprotein  29.18 
 
 
582 aa  217  9e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.707378 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1162  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.42 
 
 
569 aa  216  1e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>