16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1090 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1090  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  163  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.869282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1268  hypothetical protein  98.77 
 
 
81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.277803  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1335  hypothetical protein  60.76 
 
 
84 aa  104  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000547457  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0742  hypothetical protein  56 
 
 
89 aa  99  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.568027  normal  0.756867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3227  hypothetical protein  58.44 
 
 
79 aa  98.6  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000161134  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3728  hypothetical protein  56.25 
 
 
82 aa  91.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208374  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0611  hypothetical protein  54.67 
 
 
100 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1110  hypothetical protein  49.35 
 
 
102 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.578339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1398  hypothetical protein  51.28 
 
 
85 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957454 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0909  hypothetical protein  53.95 
 
 
81 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.593051  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2812  hypothetical protein  51.28 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111717  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1149  hypothetical protein  48.05 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01280  hypothetical protein  50.68 
 
 
91 aa  83.6  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3016  hypothetical protein  48.75 
 
 
84 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.93406e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2789  hypothetical protein  44.16 
 
 
82 aa  77.4  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.264247  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1637  hypothetical protein  41.77 
 
 
83 aa  74.7  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>