More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1082 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  54.73 
 
 
739 aa  818    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  53.55 
 
 
727 aa  769    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  59.16 
 
 
734 aa  886    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  59.3 
 
 
734 aa  888    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  94.57 
 
 
455 aa  840    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  100 
 
 
738 aa  1485    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  61.67 
 
 
727 aa  946    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  42.64 
 
 
717 aa  596  1e-169  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  41.78 
 
 
747 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  43.85 
 
 
716 aa  598  1e-169  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  42.13 
 
 
721 aa  595  1e-168  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  41.91 
 
 
760 aa  588  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  39.67 
 
 
738 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  41.67 
 
 
759 aa  561  1e-158  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  41.6 
 
 
716 aa  557  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  39.86 
 
 
721 aa  541  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  39.2 
 
 
722 aa  538  1e-151  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  38.83 
 
 
715 aa  514  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  37.09 
 
 
906 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  37.23 
 
 
906 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  36.67 
 
 
908 aa  492  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  35.56 
 
 
1038 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  35.56 
 
 
1038 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  36.65 
 
 
908 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  36.02 
 
 
1019 aa  476  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  34.63 
 
 
1011 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  35 
 
 
1013 aa  465  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  59.57 
 
 
521 aa  459  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.28 
 
 
1018 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  33.89 
 
 
1040 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  32.68 
 
 
1042 aa  438  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.81 
 
 
1018 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  34.81 
 
 
1018 aa  435  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.06 
 
 
1024 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  31.04 
 
 
722 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  32.07 
 
 
722 aa  404  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  32.21 
 
 
715 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  32.87 
 
 
716 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.3 
 
 
1008 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.3 
 
 
1008 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  31.22 
 
 
726 aa  395  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.68 
 
 
1003 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.19 
 
 
1000 aa  386  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.74 
 
 
999 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  31.69 
 
 
930 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  30.13 
 
 
741 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  31.14 
 
 
714 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  30.96 
 
 
725 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  33.83 
 
 
730 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  31.3 
 
 
743 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  31.09 
 
 
736 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  30.69 
 
 
739 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  30.99 
 
 
725 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  31.7 
 
 
738 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  30.53 
 
 
726 aa  368  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.56 
 
 
720 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.87 
 
 
865 aa  369  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  32.28 
 
 
720 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  30.4 
 
 
743 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.36 
 
 
1013 aa  365  1e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  32.2 
 
 
892 aa  365  2e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  29.89 
 
 
731 aa  364  3e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.92 
 
 
1001 aa  364  4e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  33.56 
 
 
728 aa  361  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.39 
 
 
1016 aa  362  2e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  29.14 
 
 
731 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0318  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  94.48 
 
 
181 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.91 
 
 
1012 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  30.91 
 
 
726 aa  357  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  32.38 
 
 
737 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.97 
 
 
1006 aa  352  2e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  31.95 
 
 
741 aa  352  2e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  30.39 
 
 
712 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  32.26 
 
 
1717 aa  350  5e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  31.33 
 
 
705 aa  350  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  28.31 
 
 
986 aa  349  8e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  28.77 
 
 
728 aa  347  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  28.63 
 
 
728 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  29.43 
 
 
712 aa  344  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  29.43 
 
 
712 aa  344  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  28.85 
 
 
750 aa  344  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  30.29 
 
 
725 aa  343  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  31.62 
 
 
720 aa  343  5.999999999999999e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.3 
 
 
971 aa  343  7e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  31.62 
 
 
720 aa  342  1e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  31.3 
 
 
980 aa  341  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  32.32 
 
 
706 aa  341  4e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.46 
 
 
976 aa  340  4e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  33.27 
 
 
714 aa  340  5e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  30.38 
 
 
727 aa  340  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  29.39 
 
 
712 aa  340  7e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  29.73 
 
 
723 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  29.73 
 
 
723 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  30.19 
 
 
975 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  31.21 
 
 
735 aa  337  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  32.24 
 
 
699 aa  336  7.999999999999999e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  30.22 
 
 
727 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  27.97 
 
 
724 aa  336  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  27.97 
 
 
724 aa  336  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5250  ABC transporter related  29.54 
 
 
802 aa  334  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>