More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1067 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1067  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
552 aa  1138  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  5.13816e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1255  glutamyl-tRNA synthetase  99.64 
 
 
552 aa  1136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000171529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0648  glutamyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 
546 aa  563  1e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 
494 aa  256  1e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 
492 aa  251  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 
493 aa  248  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 
504 aa  244  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 
480 aa  240  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
505 aa  237  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
502 aa  234  3e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 
517 aa  232  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
502 aa  232  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 
504 aa  230  4e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 
488 aa  230  4e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 
500 aa  229  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
493 aa  227  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
495 aa  227  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 
500 aa  227  5e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 
502 aa  227  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  31.56 
 
 
495 aa  226  7e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
509 aa  226  8e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
502 aa  226  8e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
509 aa  225  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  32.07 
 
 
503 aa  226  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 
506 aa  224  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 
496 aa  224  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 
493 aa  223  5e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 
490 aa  223  7e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.92193e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 
485 aa  223  9e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.49346e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  31.89 
 
 
503 aa  223  1e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 
477 aa  221  2e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 
503 aa  221  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 
512 aa  221  3e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
506 aa  221  3e-56  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 
487 aa  221  3e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 
493 aa  221  4e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
484 aa  220  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
493 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 
494 aa  220  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
506 aa  220  5e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  4.64542e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
493 aa  220  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 
484 aa  219  8e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
493 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
514 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 
494 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
493 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
493 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 
509 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 
489 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 
484 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
493 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 
491 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
493 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 
490 aa  216  6e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
501 aa  216  1e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 
494 aa  216  1e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 
516 aa  215  2e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 
507 aa  214  2e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
504 aa  214  2e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
486 aa  214  2e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.07745e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 
511 aa  214  3e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 
479 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 
494 aa  212  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
535 aa  213  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 
488 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  31.89 
 
 
492 aa  211  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 
485 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 
484 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 
498 aa  209  8e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 
504 aa  209  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  33.08 
 
 
485 aa  209  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.2897e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  30.06 
 
 
488 aa  207  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.04549e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 
476 aa  206  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
503 aa  206  8e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 
485 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.30888e-08  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 
510 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 
481 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 
485 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.67432e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01030  Glutamyl-tRNA synthetase, putative  39.52 
 
 
588 aa  204  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.116915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 
466 aa  203  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 
492 aa  202  9e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 
469 aa  202  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  1.59151e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 
491 aa  202  1e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.57278e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 
482 aa  202  1e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 
479 aa  202  2e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
505 aa  201  3e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
494 aa  201  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 
491 aa  200  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.69227e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  32.18 
 
 
491 aa  200  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  29.48 
 
 
495 aa  199  1e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 
490 aa  199  1e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 
464 aa  199  1e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
485 aa  198  2e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.68632e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 
488 aa  198  2e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
485 aa  198  2e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.96162e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
485 aa  198  2e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  9.37191e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
485 aa  198  2e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  4.57939e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
485 aa  199  2e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.36948e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
485 aa  198  2e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.72568e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 
490 aa  198  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>