More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1055 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1243  sensory box histidine kinase  75.28 
 
 		 623 aa  873    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1055  sensory box histidine kinase/response regulator  100 
 
 		 558 aa  1085    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.952288  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0286  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.17 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 652 aa  207  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1523  sensory box histidine kinase  42.36 
 
 		 787 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00153524  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1316  sensory box histidine kinase  42.36 
 
 		 787 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00351204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3383  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 617 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2076  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 387 aa  183  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52949  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0195  sensory box histidine kinase  42.86 
 
 		 791 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00184929  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0198  sensory box histidine kinase  34.91 
 
 		 791 aa  180  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00155091  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  40.25 
 
 		 1086 aa  176  9e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0511  histidine kinase  36.88 
 
 		 440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000775208  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  39.83 
 
 		 1093 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1953  sensor histidine kinase  36.31 
 
 		 678 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.105844  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2241  sensor histidine kinase  43.37 
 
 		 678 aa  156  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00553102  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 1153 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 		 1426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  32.61 
 
 		 1299 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 1048 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1390 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1390 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1390 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 763 aa  150  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 1385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  32.35 
 
 		 1202 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.05 
 
 		 957 aa  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  36.51 
 
 		 1306 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  31.62 
 
 		 565 aa  147  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 770 aa  146  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.31 
 
 		 1051 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 646 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  33.91 
 
 		 1427 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 1631 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.2 
 
 		 1514 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.63 
 
 		 1514 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 		 778 aa  144  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 1383 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 1383 aa  144  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 767 aa  143  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.23 
 
 		 1120 aa  143  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.54 
 
 		 1152 aa  143  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 1131 aa  143  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  32.32 
 
 		 1378 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 1140 aa  141  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 1361 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.4 
 
 		 1267 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 625 aa  141  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  28.81 
 
 		 1172 aa  140  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 		 691 aa  140  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 1178 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 1415 aa  140  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1248 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  33.06 
 
 		 1366 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 1651 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1834  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 		 569 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 		 823 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 568 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  31.56 
 
 		 1378 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  34.35 
 
 		 1156 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  31.76 
 
 		 576 aa  139  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 		 1646 aa  139  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  34.62 
 
 		 1374 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 489 aa  138  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 1118 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 		 1406 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 827 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 1013 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 		 1559 aa  137  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 585 aa  136  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 1029 aa  136  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 		 593 aa  136  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5320  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.71 
 
 		 903 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 1287 aa  136  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 		 1363 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  35.8 
 
 		 773 aa  136  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  31.82 
 
 		 876 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  32.8 
 
 		 587 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0139  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 1066 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  32.8 
 
 		 587 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  32.8 
 
 		 587 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  32.8 
 
 		 587 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  32.8 
 
 		 587 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  32.8 
 
 		 587 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 911 aa  135  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5450  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.35 
 
 		 799 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 1431 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 		 1659 aa  134  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  33.47 
 
 		 587 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 		 1499 aa  134  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 		 944 aa  134  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 1003 aa  134  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 885 aa  134  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 587 aa  134  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  32.12 
 
 		 1397 aa  134  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  34.19 
 
 		 1366 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3913  PAS sensor protein  31.85 
 
 		 1337 aa  133  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.290527  normal  0.28306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.7 
 
 		 530 aa  133  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  32.4 
 
 		 587 aa  133  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 1352 aa  133  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 1877 aa  133  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>