More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1042 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1042  translation elongation factor G, putative  100 
 
 
646 aa  1307  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  2.07187e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1233  putative tetracycline resistance protein  95.51 
 
 
646 aa  1261  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.139219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  47.29 
 
 
888 aa  603  1e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  45.58 
 
 
882 aa  597  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  46.5 
 
 
885 aa  587  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  46.05 
 
 
880 aa  567  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0030  translation elongation factor (GTPase)  43.34 
 
 
640 aa  521  1e-146  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1679  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  40.95 
 
 
642 aa  487  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0089  translation elongation factor  44.69 
 
 
751 aa  296  5e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3033  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  30.47 
 
 
647 aa  274  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2763  tetracycline resistance protein  30.06 
 
 
647 aa  271  3e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3046  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  30.47 
 
 
647 aa  271  3e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  28.19 
 
 
691 aa  270  8e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  9.20124e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  28.59 
 
 
691 aa  269  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2800  tetracycline resistance protein  29.84 
 
 
647 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3072  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  29.84 
 
 
647 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  28.44 
 
 
691 aa  267  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  28.44 
 
 
691 aa  267  5e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2204  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  29.84 
 
 
647 aa  267  6e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.335897  hitchhiker  1.06418e-13 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3042  tetracycline resistance protein  29.82 
 
 
647 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2828  tetracycline resistance protein  29.82 
 
 
647 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  28.65 
 
 
704 aa  266  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  3.38261e-05  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3077  tetracycline resistance protein  29.68 
 
 
647 aa  266  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.306394  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  28.05 
 
 
697 aa  263  5e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.25345e-06  unclonable  1.75981e-07 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2829  small GTP-binding protein  29.66 
 
 
647 aa  263  7e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328333  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0246  elongation factor G  28.32 
 
 
695 aa  261  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16321  elongation factor G  27.5 
 
 
691 aa  261  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  27.8 
 
 
694 aa  261  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  27.3 
 
 
691 aa  260  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  28.22 
 
 
691 aa  259  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  28.01 
 
 
696 aa  259  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3303  elongation factor G  27.46 
 
 
695 aa  258  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0253676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0084  translation elongation factor G  26.68 
 
 
692 aa  258  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16891  elongation factor G  28.14 
 
 
691 aa  257  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.900412  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  29.39 
 
 
691 aa  257  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  28.22 
 
 
691 aa  256  6e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  28.06 
 
 
691 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  28.06 
 
 
691 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  27.92 
 
 
704 aa  256  8e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  2.63654e-07  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.42 
 
 
692 aa  256  8e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  1.71204e-05 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  27.43 
 
 
699 aa  256  9e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.03691e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  27.43 
 
 
699 aa  256  9e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  29.48 
 
 
704 aa  256  1e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  28.25 
 
 
692 aa  255  2e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  8.15728e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  28.03 
 
 
704 aa  255  2e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.62154e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  26.73 
 
 
692 aa  255  2e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1075  elongation factor G  27.2 
 
 
691 aa  254  2e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  27.58 
 
 
691 aa  254  3e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  27.92 
 
 
691 aa  254  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0923  tetracycline resistance protein  29.49 
 
 
639 aa  254  4e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19501  elongation factor G  27.2 
 
 
691 aa  254  4e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  28.41 
 
 
700 aa  254  4e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  3.96279e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  28.27 
 
 
691 aa  254  4e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  27.92 
 
 
691 aa  254  5e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  27.92 
 
 
691 aa  254  5e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1261  elongation factor G  27.83 
 
 
700 aa  254  5e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  26.91 
 
 
704 aa  253  6e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  26.38 
 
 
699 aa  253  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  1.39334e-08 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  28.34 
 
 
691 aa  253  6e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  2.60019e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  26.38 
 
 
699 aa  253  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  27.29 
 
 
692 aa  253  7e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23631  elongation factor G  27.65 
 
 
691 aa  252  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1214  translation elongation and release factor (GTPase)  27.11 
 
 
673 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000546094  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  28.22 
 
 
691 aa  251  2e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  26.72 
 
 
691 aa  251  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1044  translation elongation factor G  25.71 
 
 
706 aa  250  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000201593  hitchhiker  0.00441639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1356  elongation factor G  27.04 
 
 
690 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.442943  normal  0.0310801 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  27.05 
 
 
704 aa  251  4e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  7.67386e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  27.64 
 
 
697 aa  250  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  27.85 
 
 
697 aa  250  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  27.7 
 
 
690 aa  250  6e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2426  elongation factor G  27.59 
 
 
704 aa  250  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  26.93 
 
 
697 aa  250  7e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  28.11 
 
 
698 aa  249  8e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  27.1 
 
 
694 aa  249  8e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  27.25 
 
 
694 aa  249  9e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  27.19 
 
 
692 aa  249  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  25.74 
 
 
691 aa  249  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1905  elongation factor G  25.15 
 
 
691 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  26.76 
 
 
692 aa  249  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.83321e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04525  elongation factor G  27.7 
 
 
690 aa  249  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00693327  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2437  elongation factor G  25.74 
 
 
691 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.318497 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  26.91 
 
 
692 aa  249  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.76822e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  25.18 
 
 
692 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  28.17 
 
 
698 aa  248  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  26.93 
 
 
692 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.05392e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  27.42 
 
 
692 aa  249  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3863  elongation factor G  27.73 
 
 
700 aa  248  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  27.16 
 
 
698 aa  248  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  26.58 
 
 
689 aa  248  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  27.02 
 
 
692 aa  247  5e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  27.21 
 
 
692 aa  247  5e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.90247e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  27.21 
 
 
692 aa  247  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  28.15 
 
 
691 aa  247  6e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.88442e-06  decreased coverage  2.4327e-05 
 
 
-
 
NC_002978  WD0016  elongation factor G  28.25 
 
 
691 aa  247  6e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  27.21 
 
 
692 aa  247  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  27.02 
 
 
692 aa  246  7e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  27.34 
 
 
697 aa  246  7e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0335  elongation factor G  28.26 
 
 
700 aa  246  8e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000657567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  25.37 
 
 
691 aa  246  9e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>