272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1038 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  98.55 
 
 
484 aa  941  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00112359  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1038  Na+/H+ antiporter, putative  100 
 
 
484 aa  956  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  7.29524e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  37.24 
 
 
609 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  37.24 
 
 
609 aa  241  3e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  37.24 
 
 
609 aa  241  3e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.24 
 
 
609 aa  241  3e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  37.24 
 
 
609 aa  241  3e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.24 
 
 
609 aa  241  3e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  36.98 
 
 
609 aa  239  6e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  36.72 
 
 
609 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  36.98 
 
 
609 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.72 
 
 
609 aa  237  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  31.21 
 
 
614 aa  229  9e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  1.04046e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  37.04 
 
 
611 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.17586e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  37.05 
 
 
609 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  34.33 
 
 
614 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  34.33 
 
 
614 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  33.11 
 
 
609 aa  212  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  3.97977e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  36.64 
 
 
608 aa  196  9e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  4.63033e-05  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1889  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 
402 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0897  sodium/hydrogen exchanger  27.75 
 
 
398 aa  114  4e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1795  sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 
389 aa  112  1e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1839  sodium/hydrogen exchanger  25.67 
 
 
416 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1786  sodium/hydrogen exchanger  25.19 
 
 
402 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612452  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0565  sodium/hydrogen exchanger  25.53 
 
 
385 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3791  sodium/hydrogen exchanger  26.82 
 
 
406 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170031  normal  0.685719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0341  sodium/hydrogen exchanger  24.58 
 
 
401 aa  97.1  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.972997  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1763  sodium/hydrogen exchanger  25.19 
 
 
406 aa  96.7  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94499e-13 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1549  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.13 
 
 
387 aa  94.7  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  26.07 
 
 
379 aa  94  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1177  sodium/hydrogen exchanger  25.8 
 
 
392 aa  89.7  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  25.5 
 
 
395 aa  87.8  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  26.6 
 
 
375 aa  86.3  1e-15  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  24.1 
 
 
389 aa  81.6  3e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1900  sodium/hydrogen exchanger  25.27 
 
 
557 aa  81.3  4e-14  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  1.33298e-09 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  25.53 
 
 
375 aa  79.7  1e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  26.96 
 
 
414 aa  79.3  1e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0334  sodium/hydrogen exchanger  24.16 
 
 
378 aa  78.2  3e-13  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  24.27 
 
 
375 aa  77  6e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  24.27 
 
 
375 aa  77  6e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  24.27 
 
 
375 aa  77  6e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  24.27 
 
 
375 aa  77  6e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0177  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.54 
 
 
388 aa  76.6  1e-12  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.193512  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  25.64 
 
 
530 aa  75.1  2e-12  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  24 
 
 
375 aa  75.5  2e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  24.34 
 
 
375 aa  75.1  3e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  23.73 
 
 
375 aa  73.9  5e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  28.35 
 
 
751 aa  74.3  5e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0575  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.7 
 
 
389 aa  72.8  1e-11  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.77521  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.61 
 
 
386 aa  72.8  1e-11  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 
712 aa  72.4  2e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  26.33 
 
 
388 aa  72.4  2e-11  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0178  Na+/H+ antiporter  23.4 
 
 
386 aa  72.4  2e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  5.77111e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  22.98 
 
 
679 aa  71.2  3e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  24.3 
 
 
719 aa  71.6  3e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.87 
 
 
399 aa  70.5  7e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  25.89 
 
 
721 aa  70.1  8e-11  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  25.73 
 
 
388 aa  69.7  1e-10  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  23.6 
 
 
414 aa  69.3  1e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  25.52 
 
 
388 aa  69.7  1e-10  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  23.1 
 
 
382 aa  69.7  1e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  26.65 
 
 
716 aa  69.3  1e-10  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  22.84 
 
 
389 aa  69.7  1e-10  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  24.81 
 
 
414 aa  69.3  2e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 
412 aa  68.6  2e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  24.87 
 
 
585 aa  68.2  3e-10  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0159  Na+/H+ antiporter  24.27 
 
 
392 aa  68.2  3e-10  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1944  Sodium/hydrogen exchanger  23.81 
 
 
382 aa  68.2  3e-10  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2288  radical SAM protein  22.87 
 
 
387 aa  67.8  4e-10  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  25.46 
 
 
388 aa  67.4  5e-10  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  24.38 
 
 
692 aa  67.4  5e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  23.57 
 
 
698 aa  67.4  6e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  25.37 
 
 
722 aa  67.4  6e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  22.7 
 
 
387 aa  66.6  8e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  4.27463e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  23.37 
 
 
698 aa  66.6  9e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  22.7 
 
 
387 aa  66.6  1e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  22.7 
 
 
387 aa  66.6  1e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.97564e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  22.34 
 
 
389 aa  66.2  1e-09  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  22.43 
 
 
387 aa  66.2  1e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  24.53 
 
 
375 aa  66.2  1e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  22.7 
 
 
387 aa  66.2  1e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.35632e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  22.7 
 
 
387 aa  66.2  1e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  22.43 
 
 
387 aa  66.2  1e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  6.01236e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1031  sodium/hydrogen exchanger  25.69 
 
 
386 aa  65.9  2e-09  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.819756  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  24.46 
 
 
681 aa  65.9  2e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  26.92 
 
 
715 aa  64.7  3e-09  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  24.27 
 
 
375 aa  64.7  3e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  21.76 
 
 
387 aa  64.7  3e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  22.43 
 
 
387 aa  65.1  3e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  22.7 
 
 
387 aa  65.1  3e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.02392e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0168  Sodium/hydrogen exchanger  24.8 
 
 
387 aa  64.7  3e-09  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  24.27 
 
 
375 aa  64.7  3e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  23.58 
 
 
750 aa  63.9  6e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  26.97 
 
 
584 aa  63.9  6e-09  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 
396 aa  63.9  7e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2056  sodium/hydrogen exchanger family protein  21.68 
 
 
391 aa  63.5  7e-09  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  27.25 
 
 
582 aa  63.5  9e-09  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1067  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  23.67 
 
 
541 aa  63.2  1e-08  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000268693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  20.8 
 
 
387 aa  63.2  1e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4840  sodium/hydrogen exchanger  21.22 
 
 
395 aa  62.8  1e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>