More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1019 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  99.77 
 
 		 435 aa  844    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  100 
 
 		 435 aa  846    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1396  sodium:dicarboxylate symporter  41.15 
 
 		 450 aa  319  7e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000220299  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  40.24 
 
 		 417 aa  309  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  41.9 
 
 		 419 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  41.9 
 
 		 419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  41.9 
 
 		 419 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  41.9 
 
 		 419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  40.75 
 
 		 441 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  41.65 
 
 		 416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  40.66 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  42.42 
 
 		 419 aa  292  6e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  38.83 
 
 		 433 aa  289  6e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  40.91 
 
 		 417 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  40.24 
 
 		 416 aa  286  5e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  40.16 
 
 		 416 aa  286  7e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  40.66 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  39.85 
 
 		 426 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  40.21 
 
 		 410 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  40.4 
 
 		 417 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  37.81 
 
 		 424 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  37.81 
 
 		 440 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  37.81 
 
 		 440 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  37.56 
 
 		 443 aa  277  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  37.81 
 
 		 435 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  37.28 
 
 		 432 aa  275  9e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  38.11 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  37.85 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  37.85 
 
 		 444 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  37.6 
 
 		 444 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  35.66 
 
 		 449 aa  270  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  37.69 
 
 		 430 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0480  sodium:dicarboxylate symporter  34.65 
 
 		 428 aa  263  4e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0200306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  36.43 
 
 		 417 aa  257  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  35.7 
 
 		 409 aa  256  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0025  sodium/dicarboxylate symporter  37.53 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.181863  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0052  sodium/dicarboxylate symporter  37.53 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  34.39 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  33.69 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0027  sodium/dicarboxylate symporter  37.07 
 
 		 461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  33.65 
 
 		 437 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  33.98 
 
 		 436 aa  230  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  33.89 
 
 		 436 aa  229  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  35.73 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  33.18 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  33.89 
 
 		 437 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  33.65 
 
 		 437 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  34.74 
 
 		 436 aa  226  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  32.69 
 
 		 437 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  31.99 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  31.73 
 
 		 434 aa  222  9e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  32.69 
 
 		 440 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  32.45 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  36.32 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  32.45 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  32.14 
 
 		 433 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  32.21 
 
 		 440 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  33.82 
 
 		 424 aa  220  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02122  hypothetical protein  33.11 
 
 		 457 aa  219  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  32.69 
 
 		 441 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  33.42 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  33.74 
 
 		 405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0856  sodium/dicarboxylate symporter  34.53 
 
 		 471 aa  216  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  34.5 
 
 		 439 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  31.91 
 
 		 452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  32.52 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  31.82 
 
 		 437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  31.82 
 
 		 437 aa  213  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003695  sodium/dicarboxylate symporter  34.99 
 
 		 457 aa  213  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1813  sodium/dicarboxylate symporter  33.75 
 
 		 456 aa  212  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0716204  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1660  Na+/H+-dicarboxylate symporter  33.77 
 
 		 480 aa  210  4e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000719973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  32.27 
 
 		 445 aa  210  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  31.68 
 
 		 434 aa  209  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6394  sodium:dicarboxylate symporter  34.74 
 
 		 446 aa  209  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  31.4 
 
 		 434 aa  209  7e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  33.95 
 
 		 438 aa  209  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  29.8 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  34.09 
 
 		 409 aa  207  4e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  31.81 
 
 		 420 aa  207  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  32.62 
 
 		 419 aa  206  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  30.45 
 
 		 440 aa  205  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  31.08 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  31.52 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  31.52 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1315  sodium:dicarboxylate symporter  33.97 
 
 		 435 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  34.5 
 
 		 437 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  32.54 
 
 		 436 aa  204  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  30.19 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  31.59 
 
 		 416 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  31.08 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5150  sodium:dicarboxylate symporter  31.74 
 
 		 520 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  31.59 
 
 		 416 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  33.25 
 
 		 419 aa  203  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5183  sodium:dicarboxylate symporter  34.56 
 
 		 463 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  30.84 
 
 		 411 aa  202  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  30.84 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.84 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.84 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>