17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1004 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2281  propanediol utilization dehydratase, large subunit  69.31 
 
 		 554 aa  830    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0284  Glycerol dehydratase  63.1 
 
 		 564 aa  756    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1031  Glycerol dehydratase  75.23 
 
 		 553 aa  887    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00671582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2376  propanediol utilization dehydratase, large subunit  70.04 
 
 		 554 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2163  propanediol utilization dehydratase, large subunit  69.86 
 
 		 554 aa  834    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2210  propanediol utilization dehydratase, large subunit  70.04 
 
 		 554 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2263  propanediol utilization dehydratase large subunit  69.86 
 
 		 554 aa  834    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.131408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2217  propanediol utilization dehydratase large subunit  70.04 
 
 		 554 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1953  glycerol dehydratase  72.51 
 
 		 554 aa  842    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1747  glycerol dehydratase  63.06 
 
 		 558 aa  739    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1004  glycerol dehydratase, alpha subunit  100 
 
 		 554 aa  1140    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.872763  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1173  coenzyme B12-dependent glycerol dehydratase, large subunit  100 
 
 		 554 aa  1140    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5563  glycerol dehydratase  50.19 
 
 		 746 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.811495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1245  glycerol dehydratase  49.63 
 
 		 746 aa  512  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00307379  decreased coverage  0.00000439875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5335  glycerol dehydratase  48.42 
 
 		 739 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4954  glycerol dehydratase  48.42 
 
 		 739 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5042  glycerol dehydratase  48.42 
 
 		 739 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>