25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0949 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0949  chitinase B  100 
 
 
64 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00782065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  95.31 
 
 
2638 aa  120  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0647  chitinase-related protein  58.18 
 
 
105 aa  59.3  2e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1144  hypothetical protein  51.79 
 
 
105 aa  53.1  1e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0791111  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1122  hypothetical protein  51.79 
 
 
105 aa  53.1  1e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0136739  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0390  polysaccharide lyase family protein 8  40 
 
 
985 aa  50.1  1e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.918566  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  50 
 
 
2142 aa  50.1  1e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0394  polysaccharide lyase family protein 8  40 
 
 
1003 aa  49.7  1e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2310  bacillolysin  49.15 
 
 
886 aa  49.3  2e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2571  neutral protease A, bacillolysin  57.14 
 
 
891 aa  48.9  2e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  4.42231e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2348  bacillolysin (neutral protease)  50.85 
 
 
890 aa  47.8  5e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00113983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2789  bacillolysin  52.54 
 
 
893 aa  47.8  5e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000716183  hitchhiker  1.52737e-07 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2534  neutral protease  52.54 
 
 
887 aa  47.4  7e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.596256  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2581  neutral protease  50.85 
 
 
884 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1855e-15 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  39.68 
 
 
565 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2624  bacillolysin  47.46 
 
 
891 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  6.36329e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 
727 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  41.67 
 
 
699 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2393  thermolysin metallopeptidase  47.46 
 
 
530 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  45.45 
 
 
729 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  45.45 
 
 
729 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  38.98 
 
 
1465 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93602  predicted protein  41.51 
 
 
2146 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00915503 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2383  putative surface protein  40.98 
 
 
929 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  37.29 
 
 
1687 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>