More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0938 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  100 
 
 
696 aa  1438  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  92.67 
 
 
696 aa  1305  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0290  hydrogenase, Fe-only  48.28 
 
 
549 aa  464  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0463  hydrogenases, Fe-only  49.44 
 
 
520 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0168  hydrogenase, Fe-only  49.1 
 
 
513 aa  455  1e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.191335  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  47.88 
 
 
527 aa  447  1e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0157  hydrogenase, Fe-only  48.44 
 
 
523 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.434937  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  45.71 
 
 
581 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  8.65974e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  46.15 
 
 
582 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  46.32 
 
 
579 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1651  hydrogenases, Fe-only  46.34 
 
 
593 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.556328  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  48.78 
 
 
582 aa  392  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  48.55 
 
 
578 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  45.22 
 
 
582 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  48.14 
 
 
578 aa  382  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1783  hydrogenase, Fe-only  48.81 
 
 
583 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0147  [Fe] hydrogenase, large subunit HymC, putative  46.14 
 
 
573 aa  381  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_155  [Fe] hydrogenase, Hym C subunit  46.14 
 
 
573 aa  381  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0224  hydrogenase, Fe-only  45.03 
 
 
573 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1717  Iron hydrogenase, small subunit  45.47 
 
 
573 aa  379  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.118526  normal  0.410336 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  43.43 
 
 
594 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  45.35 
 
 
573 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  45.07 
 
 
574 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  46.14 
 
 
580 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  43.46 
 
 
582 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1337  hydrogenase, Fe-only  45.99 
 
 
590 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  41.7 
 
 
615 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1544  hydrogenase, Fe-only  44.23 
 
 
581 aa  361  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  45.37 
 
 
586 aa  361  3e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  43.68 
 
 
572 aa  359  9e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0747  hydrogenase, Fe-only  43.27 
 
 
582 aa  358  1e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0723  hydrogenase, Fe-only  43.58 
 
 
582 aa  358  2e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  42.79 
 
 
572 aa  353  8e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0150  hydrogenase, Fe-only  43.08 
 
 
585 aa  351  2e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0844  hydrogenases, Fe-only  42.6 
 
 
576 aa  352  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1384  hydrogenases, Fe-only  40.7 
 
 
606 aa  349  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  43.78 
 
 
570 aa  348  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1149  hydrogenase, Fe-only  45.45 
 
 
569 aa  347  4e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  2.53121e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3829  hydrogenase, Fe-only  40.86 
 
 
625 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  41.5 
 
 
666 aa  342  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2502  iron-containing hydrogenase, Hyd gamma  43.33 
 
 
598 aa  341  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0475  ferredoxin hydrogenase  39.74 
 
 
458 aa  337  4e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0533  hydrogenase, Fe-only  44.75 
 
 
582 aa  337  5e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0310904  normal  0.240554 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2436  (Fe) hydrogenase, large subunit HymC, putative  43.02 
 
 
563 aa  335  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.28912e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1633  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  42.98 
 
 
585 aa  334  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000469619  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2159  hydrogenase, Fe-only  43.18 
 
 
582 aa  333  6e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0625  hydrogenase, Fe-only  43.18 
 
 
587 aa  332  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.44729e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  43.11 
 
 
417 aa  332  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  38.65 
 
 
601 aa  331  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1085  hydrogenase, Fe-only  44.25 
 
 
577 aa  330  4e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1605  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  41.41 
 
 
585 aa  330  6e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  43.77 
 
 
439 aa  330  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  41.16 
 
 
562 aa  330  8e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1017  iron hydrogenase, small subunit  42.19 
 
 
574 aa  328  2e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3601  hydrogenase, Fe-only  41.61 
 
 
587 aa  325  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1925  ferredoxin hydrogenase  44.7 
 
 
387 aa  324  4e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0723  hydrogenase, Fe-only  41.7 
 
 
578 aa  323  5e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0137  hydrogenase, Fe-only  36.82 
 
 
619 aa  322  1e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  46.48 
 
 
421 aa  320  5e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  39.82 
 
 
566 aa  313  9e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  58.13 
 
 
392 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  39.25 
 
 
567 aa  308  2e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3003  hydrogenase, Fe-only  39.43 
 
 
644 aa  306  6e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  35.9 
 
 
460 aa  305  2e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  42.7 
 
 
418 aa  300  9e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  40.23 
 
 
659 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1593  Fe-hydrogenase  40.58 
 
 
596 aa  296  7e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  43.38 
 
 
421 aa  296  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  37.12 
 
 
1150 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  40.78 
 
 
410 aa  288  3e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  39.3 
 
 
644 aa  287  5e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.10653e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  40.52 
 
 
410 aa  285  2e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  1.63586e-05 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  38.58 
 
 
667 aa  283  6e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  40 
 
 
410 aa  282  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  8.73565e-05 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  38 
 
 
653 aa  264  5e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16530  hydrogenase, Fe-only  36.44 
 
 
569 aa  263  9e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.143158  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  54.66 
 
 
221 aa  258  4e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  2.56435e-05  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  36.48 
 
 
645 aa  248  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  36.48 
 
 
645 aa  247  6e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  35.78 
 
 
666 aa  241  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  59.43 
 
 
179 aa  214  3e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  57.14 
 
 
179 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  60.11 
 
 
179 aa  209  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  59.77 
 
 
178 aa  206  9e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.418e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  55.68 
 
 
179 aa  204  6e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  56.9 
 
 
178 aa  202  2e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.07395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  56.32 
 
 
178 aa  201  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  58.52 
 
 
180 aa  201  4e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  56.32 
 
 
177 aa  201  4e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.07911e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  56.25 
 
 
179 aa  200  9e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  51.72 
 
 
178 aa  198  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  50.27 
 
 
191 aa  188  3e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  51.72 
 
 
178 aa  188  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  49.73 
 
 
188 aa  187  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  48.66 
 
 
192 aa  186  9e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  52.63 
 
 
179 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  52.63 
 
 
179 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  49.2 
 
 
191 aa  182  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  1.1253e-05 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  48.66 
 
 
190 aa  182  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  49.2 
 
 
190 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>