125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0883 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  333  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  90.32 
 
 
185 aa  279  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.92 
 
 
185 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  48.09 
 
 
184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  40.91 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  39.86 
 
 
186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.28 
 
 
186 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  35.17 
 
 
186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.57 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.78 
 
 
215 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.14 
 
 
195 aa  92.8  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.84 
 
 
193 aa  92.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  31.08 
 
 
200 aa  87.4  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  31.13 
 
 
200 aa  84.7  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.14 
 
 
190 aa  84.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.51 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.61 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  32.14 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  27.89 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  31.51 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  31.88 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.82 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.29 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.56 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.77 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  31.65 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  24.53 
 
 
195 aa  72  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  28.26 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  28.47 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  28.38 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  28.38 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  25.36 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  28.68 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.06 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.28 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  26.39 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.08 
 
 
195 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.15 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.12 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.62 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  28.57 
 
 
208 aa  60.8  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1335  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.86 
 
 
221 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.83 
 
 
192 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  27.21 
 
 
184 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  22.6 
 
 
189 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  24.26 
 
 
178 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  25.79 
 
 
176 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  25.29 
 
 
192 aa  57  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  26.49 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  23.65 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  25.37 
 
 
178 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  22.08 
 
 
188 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  31.34 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.3 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.76 
 
 
189 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  25.76 
 
 
176 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.57 
 
 
177 aa  55.1  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  32.23 
 
 
185 aa  54.7  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  24.03 
 
 
186 aa  53.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  26.15 
 
 
185 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  33.1 
 
 
204 aa  53.9  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  25.81 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  21.74 
 
 
181 aa  52.4  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.59 
 
 
180 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.03 
 
 
186 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.63 
 
 
176 aa  51.2  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  26.72 
 
 
194 aa  50.8  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1404  putative flavoredoxin  33.03 
 
 
178 aa  50.8  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  30.37 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  21.71 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  26.05 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  27.37 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.76 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  26.98 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  26.09 
 
 
152 aa  48.5  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  27.78 
 
 
180 aa  48.5  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  25.87 
 
 
219 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
244 aa  48.1  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.47 
 
 
180 aa  48.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  25.2 
 
 
167 aa  47.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1255  flavin reductase domain-containing protein  23.57 
 
 
216 aa  47.8  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  26.43 
 
 
177 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.51 
 
 
227 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.67 
 
 
203 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  21.97 
 
 
195 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.15 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.08 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.08 
 
 
225 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.9 
 
 
195 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0361  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.99 
 
 
200 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2464  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.13 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.88 
 
 
192 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.57 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  19.86 
 
 
186 aa  45.1  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.85 
 
 
194 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  25.89 
 
 
187 aa  44.7  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.88 
 
 
215 aa  44.7  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  26.55 
 
 
149 aa  44.3  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  26.55 
 
 
149 aa  44.3  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>