More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0866 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0866  DedA family protein  100 
 
 
208 aa  406  1e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  4.3469e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0884  DedA family protein  95.67 
 
 
208 aa  349  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  41.34 
 
 
207 aa  140  2e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  40.78 
 
 
207 aa  138  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  36.06 
 
 
202 aa  105  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  30.26 
 
 
202 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  33.83 
 
 
205 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  34.63 
 
 
201 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  35 
 
 
212 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.33 
 
 
203 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  32.18 
 
 
212 aa  99.8  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  36.13 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  30.14 
 
 
203 aa  99  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  28.5 
 
 
211 aa  98.6  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  32.18 
 
 
200 aa  98.6  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0884  SNARE associated Golgi protein  36.49 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.141066  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.5 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  31 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  28.78 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  35.62 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  35.62 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  28.29 
 
 
213 aa  94.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.74 
 
 
228 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1476  alkaline phosphatase-like protein  35.29 
 
 
165 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  34.93 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.33 
 
 
221 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  30.1 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  30.24 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  28.5 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  30.93 
 
 
195 aa  92  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.95 
 
 
201 aa  91.7  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  29.23 
 
 
208 aa  91.3  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.31966e-10  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  27.41 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  28.44 
 
 
215 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  26.15 
 
 
198 aa  91.3  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  26.13 
 
 
198 aa  90.9  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  30.54 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  28.18 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.02 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1745  DedA family protein  33.99 
 
 
165 aa  89  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0507809  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  27.09 
 
 
209 aa  89  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  27.18 
 
 
206 aa  88.6  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  2.82866e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  26.87 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  33.56 
 
 
202 aa  88.2  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  30.5 
 
 
202 aa  88.2  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  25.48 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  29.63 
 
 
213 aa  85.9  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  30.11 
 
 
325 aa  83.6  2e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  31.93 
 
 
202 aa  83.2  3e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  3.49657e-07  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  33.74 
 
 
248 aa  82.4  5e-15  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.05 
 
 
241 aa  82  5e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  25.12 
 
 
215 aa  80.9  1e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 
197 aa  81.3  1e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  31.97 
 
 
200 aa  80.9  1e-14  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  24.76 
 
 
224 aa  81.3  1e-14  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 
239 aa  80.1  2e-14  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  29.9 
 
 
202 aa  80.5  2e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  29.57 
 
 
198 aa  80.5  2e-14  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.63 
 
 
206 aa  80.5  2e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0213  hypothetical protein  30.1 
 
 
206 aa  79.7  2e-14  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1475  dedA protein  32.24 
 
 
166 aa  79.7  3e-14  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.937039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1744  DedA family membrane protein  32.24 
 
 
166 aa  79.7  3e-14  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0059834  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  30.62 
 
 
218 aa  79.3  4e-14  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  27.13 
 
 
205 aa  79.3  4e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  28.57 
 
 
232 aa  79  5e-14  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  25.4 
 
 
229 aa  79  5e-14  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  27.45 
 
 
202 aa  79  5e-14  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  34.04 
 
 
217 aa  79  5e-14  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.56 
 
 
231 aa  79  5e-14  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  25.91 
 
 
208 aa  77.8  9e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0174  alkaline phosphatase  28.49 
 
 
206 aa  77.8  1e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970262  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  26.37 
 
 
209 aa  77.8  1e-13  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  27.49 
 
 
205 aa  77.8  1e-13  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  32.76 
 
 
199 aa  77.4  1e-13  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  29.47 
 
 
216 aa  76.6  2e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  29.38 
 
 
202 aa  76.6  2e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  30.68 
 
 
201 aa  77  2e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  2.6283e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0534  SNARE associated Golgi protein  27.46 
 
 
203 aa  77  2e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000300058  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  30.56 
 
 
203 aa  75.9  4e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  30.56 
 
 
203 aa  75.9  4e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  25.13 
 
 
199 aa  75.9  4e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  30.22 
 
 
218 aa  75.5  5e-13  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  28.83 
 
 
218 aa  74.3  1e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  27.69 
 
 
225 aa  73.6  2e-12  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  26.11 
 
 
266 aa  73.6  2e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  32.54 
 
 
204 aa  73.9  2e-12  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  27.15 
 
 
206 aa  73.9  2e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  28.98 
 
 
201 aa  73.2  3e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.65515e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0457  DedA family protein  31.62 
 
 
169 aa  72.4  4e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00277812  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  27.42 
 
 
241 aa  72.4  5e-12  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  28.25 
 
 
205 aa  72  5e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  1.12613e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  25.62 
 
 
266 aa  72.4  5e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0210  hypothetical protein  30.07 
 
 
228 aa  71.6  8e-12  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0447  DedA family protein  31.62 
 
 
169 aa  71.6  8e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.364364  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.04 
 
 
202 aa  70.9  1e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  30.5 
 
 
228 aa  71.2  1e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0395  SNARE associated Golgi protein  28.42 
 
 
197 aa  70.9  1e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  29.06 
 
 
201 aa  70.9  1e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  29.06 
 
 
201 aa  70.9  1e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>