24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0833 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0840  alpha-clostripain  97.13 
 
 
522 aa  1044  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.832986  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0833  alpha-clostripain  100 
 
 
522 aa  1072  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458898  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  25.67 
 
 
766 aa  112  1e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1815  peptidase C11 clostripain  27.16 
 
 
748 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  24.42 
 
 
914 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  3.50123e-08 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  24.29 
 
 
1065 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  24.63 
 
 
1011 aa  87.4  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5817  peptidase C11 clostripain  25.31 
 
 
641 aa  82.4  2e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2035  peptidase C11, clostripain  24.09 
 
 
1157 aa  81.6  3e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.762463  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1281  peptidase C11, clostripain  24.32 
 
 
657 aa  81.6  3e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  30.04 
 
 
1224 aa  74.7  4e-12  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  25.94 
 
 
979 aa  70.1  1e-10  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1209  hypothetical protein  23.88 
 
 
429 aa  67.4  6e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00911503  normal  0.0218928 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2805  clostripain  22.4 
 
 
640 aa  64.7  4e-09  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1868  hypothetical protein  25.21 
 
 
431 aa  57  8e-07  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  4.89897e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2076  hypothetical protein  22.37 
 
 
623 aa  55.1  3e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.534592  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0349  hypothetical protein  24.58 
 
 
399 aa  53.5  8e-06  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.286658  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0249  peptidase C11, clostripain  25.1 
 
 
802 aa  53.5  9e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2806  clostripain  27.69 
 
 
359 aa  50.8  6e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0286  peptidase C11, clostripain  23.45 
 
 
488 aa  50.4  7e-05  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2074  clostripain  28.69 
 
 
630 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67493  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1457  hypothetical protein  21.47 
 
 
904 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4453  hypothetical protein  21.04 
 
 
624 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0421  peptidase C11 clostripain  30.33 
 
 
310 aa  45.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>