More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0828 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  99.54 
 
 
438 aa  843    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  100 
 
 
438 aa  848    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  36.94 
 
 
463 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  33.86 
 
 
454 aa  236  6e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  31.59 
 
 
456 aa  219  5e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0636  MATE efflux family protein  34.2 
 
 
454 aa  204  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  29.93 
 
 
451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.82 
 
 
460 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  30.31 
 
 
450 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  29.75 
 
 
454 aa  142  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.58 
 
 
458 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  27.15 
 
 
466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  29.56 
 
 
438 aa  131  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  28.91 
 
 
454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.62 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.28 
 
 
500 aa  128  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  30.2 
 
 
468 aa  128  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.13 
 
 
445 aa  128  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  29.58 
 
 
454 aa  126  7e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  24.84 
 
 
500 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  28.08 
 
 
456 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  25.34 
 
 
452 aa  122  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.38 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16054  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  26.02 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0679405  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.21 
 
 
475 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  25.8 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  28.64 
 
 
446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.99 
 
 
462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  28.92 
 
 
478 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2533  multi anti extrusion protein MatE  27.29 
 
 
447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000103349  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  28.37 
 
 
453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  25.4 
 
 
439 aa  118  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  28.29 
 
 
461 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  27.89 
 
 
453 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  25.47 
 
 
485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  26.4 
 
 
451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.52 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.89 
 
 
448 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  28.41 
 
 
501 aa  113  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.07 
 
 
464 aa  114  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.07 
 
 
464 aa  114  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
461 aa  113  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  26.76 
 
 
452 aa  112  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  24.55 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.21 
 
 
485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.86 
 
 
481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  28.78 
 
 
444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  26.05 
 
 
467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  27.04 
 
 
455 aa  111  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.97 
 
 
525 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.1 
 
 
475 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  26.25 
 
 
442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.82 
 
 
453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.5 
 
 
498 aa  109  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  26.25 
 
 
484 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25 
 
 
462 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  26.59 
 
 
460 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  26.29 
 
 
455 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  26.29 
 
 
455 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
462 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  23.85 
 
 
451 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  23.11 
 
 
461 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  25.78 
 
 
460 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.84 
 
 
500 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  23.68 
 
 
470 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  27.74 
 
 
520 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  28.61 
 
 
520 aa  107  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.45 
 
 
486 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  26.2 
 
 
457 aa  106  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  28.61 
 
 
517 aa  106  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  25.73 
 
 
460 aa  106  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.26 
 
 
499 aa  106  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  29.19 
 
 
515 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  27.1 
 
 
477 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  25.19 
 
 
446 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  29.19 
 
 
515 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  29.46 
 
 
515 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  29.19 
 
 
515 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  27.69 
 
 
455 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.71 
 
 
475 aa  104  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  26.17 
 
 
457 aa  104  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  23.01 
 
 
463 aa  103  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  31.65 
 
 
453 aa  103  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
462 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  26.74 
 
 
455 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  26.07 
 
 
456 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  26.64 
 
 
451 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  26.64 
 
 
451 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  23.88 
 
 
455 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  24.35 
 
 
458 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26.37 
 
 
453 aa  100  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
453 aa  99.8  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  26.65 
 
 
449 aa  99.4  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
451 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  27.86 
 
 
460 aa  99  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  26.72 
 
 
509 aa  98.2  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  23.86 
 
 
461 aa  99  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  27.8 
 
 
505 aa  97.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>