More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0814 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  100 
 
 		 451 aa  882    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  39.65 
 
 		 455 aa  325  7e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  39.23 
 
 		 447 aa  295  2e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  38.89 
 
 		 477 aa  291  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  40.33 
 
 		 447 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  40.61 
 
 		 449 aa  287  2e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  41.36 
 
 		 447 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  36.78 
 
 		 455 aa  267  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  36.55 
 
 		 455 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  38.81 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  33.86 
 
 		 454 aa  253  6e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  38.25 
 
 		 454 aa  250  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  38.58 
 
 		 456 aa  243  6e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  34.64 
 
 		 460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  35.86 
 
 		 455 aa  239  5.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  34.75 
 
 		 455 aa  238  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  36.13 
 
 		 449 aa  237  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  31.11 
 
 		 442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  35.63 
 
 		 455 aa  233  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  36.18 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  37.91 
 
 		 454 aa  219  7.999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  32.62 
 
 		 455 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  33.18 
 
 		 460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  31.06 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  32.65 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  30.86 
 
 		 493 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  32.34 
 
 		 451 aa  199  9e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  30.86 
 
 		 461 aa  197  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  30.54 
 
 		 466 aa  194  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  32.15 
 
 		 448 aa  192  8e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  33.48 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  28.67 
 
 		 466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  29.42 
 
 		 496 aa  189  5.999999999999999e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.5 
 
 		 467 aa  189  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  32.88 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  30.73 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  33.25 
 
 		 496 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  29.59 
 
 		 437 aa  187  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  29.49 
 
 		 466 aa  186  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 437 aa  186  9e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  31.79 
 
 		 456 aa  186  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  30.57 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  31.9 
 
 		 451 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  30.61 
 
 		 450 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  30.02 
 
 		 452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  28.81 
 
 		 448 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  29.2 
 
 		 452 aa  182  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  32.51 
 
 		 459 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.4 
 
 		 460 aa  180  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  29.8 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  33.82 
 
 		 466 aa  179  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  30.32 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  28.74 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  31.78 
 
 		 462 aa  177  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  29.35 
 
 		 485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  31.21 
 
 		 459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  29.78 
 
 		 442 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 440 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0460  MATE efflux family protein  30.73 
 
 		 451 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  27.11 
 
 		 446 aa  169  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  28.09 
 
 		 472 aa  167  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2170  multi anti extrusion protein MatE  27.79 
 
 		 546 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.044702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  28.78 
 
 		 451 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  28.54 
 
 		 451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  31.14 
 
 		 455 aa  164  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  27 
 
 		 451 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  30.23 
 
 		 455 aa  163  6e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  27.44 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  27.67 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 467 aa  161  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 452 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 447 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2309  multi anti extrusion protein MatE  27.37 
 
 		 541 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 460 aa  160  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 451 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  29.77 
 
 		 467 aa  160  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.79 
 
 		 472 aa  160  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  27.66 
 
 		 451 aa  159  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  27.99 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2206  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.16 
 
 		 541 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.711563  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.42 
 
 		 459 aa  157  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.27 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 456 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  27.48 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 460 aa  154  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  28.73 
 
 		 459 aa  154  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  29.55 
 
 		 445 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  29.02 
 
 		 459 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  28.74 
 
 		 458 aa  151  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  28.94 
 
 		 440 aa  150  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  28.54 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>