28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0812 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0812  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  561  1e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000113907  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0824  hypothetical protein  95.38 
 
 
260 aa  502  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000195088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0711  hypothetical protein  28.63 
 
 
244 aa  82.8  6e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0710  permease  27.47 
 
 
244 aa  82  1e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.251527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4483  putative ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 
244 aa  80.9  2e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0252052 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0963  putative ABC transporter, permease protein  27.47 
 
 
244 aa  80.5  3e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0891  ABC transporter, permease protein, putative  27.47 
 
 
244 aa  79  9e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0800  ABC transporter permease  27.47 
 
 
244 aa  78.6  1e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.93303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0895  putative ABC transporter, permease protein  27.47 
 
 
244 aa  78.6  1e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.41872e-39 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0696  permease  27.47 
 
 
244 aa  78.6  1e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0761  ABC transporter permease  27.47 
 
 
244 aa  78.6  1e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0853  putative ABC transporter, permease protein  26.51 
 
 
249 aa  77  3e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0198  hypothetical protein  23.83 
 
 
249 aa  71.2  2e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.485643  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1075  hypothetical protein  30.86 
 
 
224 aa  70.1  4e-11  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1533  hypothetical protein  34.23 
 
 
221 aa  65.1  1e-09  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.975829  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3437  hypothetical protein  27.81 
 
 
245 aa  63.2  5e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3489  hypothetical protein  27.81 
 
 
245 aa  63.2  5e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.28663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3426  hypothetical protein  27.81 
 
 
245 aa  63.2  5e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1952  hypothetical protein  29.31 
 
 
234 aa  62.8  6e-09  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.523935  normal  0.0461591 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22330  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02206  21.46 
 
 
284 aa  60.5  3e-08  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5545  hypothetical protein  23.98 
 
 
253 aa  59.3  6e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.458717  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0158  hypothetical protein  26.18 
 
 
259 aa  56.6  4e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1691  hypothetical protein  23.88 
 
 
245 aa  56.6  4e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.148884  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0770  hypothetical protein  28.12 
 
 
228 aa  56.2  6e-07  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  1.15194e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1760  hypothetical protein  23.88 
 
 
245 aa  55.8  8e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1714  hypothetical protein  23.88 
 
 
245 aa  55.8  8e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.754442  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0089  hypothetical protein  28.65 
 
 
225 aa  53.1  4e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0669519  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1968  hypothetical protein  27.34 
 
 
239 aa  51.2  2e-05  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0736708  hitchhiker  0.000925089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>