More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0754 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
236 aa  469  1e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  2.12493e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  98.31 
 
 
236 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  73.73 
 
 
236 aa  362  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  73.73 
 
 
236 aa  362  4e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
232 aa  197  8e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.91 
 
 
236 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
236 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.81 
 
 
239 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.25437e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.43 
 
 
225 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.64 
 
 
226 aa  140  2e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.61 
 
 
234 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
231 aa  130  2e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  31.05 
 
 
230 aa  130  2e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29.3 
 
 
224 aa  129  5e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  29.49 
 
 
225 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
225 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1838  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.61 
 
 
225 aa  122  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0983527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.17 
 
 
227 aa  120  2e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
254 aa  120  2e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.08 
 
 
225 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
225 aa  119  4e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.44 
 
 
226 aa  118  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.57 
 
 
226 aa  118  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.39 
 
 
225 aa  117  1e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
231 aa  118  1e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.7 
 
 
226 aa  117  1e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  30.22 
 
 
225 aa  116  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.57 
 
 
219 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.07267e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.28 
 
 
228 aa  115  7e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.93 
 
 
242 aa  115  9e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.65 
 
 
228 aa  114  9e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  28.86 
 
 
226 aa  115  9e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.57 
 
 
228 aa  114  1e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.17 
 
 
224 aa  114  1e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
233 aa  114  2e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.36 
 
 
220 aa  114  2e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  1.48221e-05 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1619  cyclic nucleotide-binding  27.48 
 
 
235 aa  114  2e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  25.78 
 
 
223 aa  112  4e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  27.85 
 
 
221 aa  112  7e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
231 aa  111  8e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
231 aa  111  8e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1939  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.11 
 
 
235 aa  110  1e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.86 
 
 
226 aa  111  1e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.57 
 
 
231 aa  111  1e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
261 aa  110  1e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  25.71 
 
 
225 aa  110  2e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
222 aa  109  4e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  3.54449e-08  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  27.91 
 
 
261 aa  108  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3114  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
232 aa  108  8e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.14 
 
 
229 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0917  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
254 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
247 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.86 
 
 
228 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
226 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2535  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
226 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.91 
 
 
238 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.62 
 
 
225 aa  106  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.44 
 
 
225 aa  105  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.31 
 
 
226 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.44 
 
 
237 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
234 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.5 
 
 
257 aa  105  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  2.04419e-05 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.7 
 
 
224 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1045  Crp-like transcriptional regulator  27.98 
 
 
229 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.44 
 
 
238 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2941  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
235 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3398  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
230 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29 
 
 
230 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
250 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2139  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29 
 
 
230 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
248 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.92 
 
 
230 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  26 
 
 
225 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.5 
 
 
227 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
231 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1678  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
230 aa  102  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.330352  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  27.23 
 
 
224 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1984  Crp/FNR family transcriptional regulator  29 
 
 
230 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.513682  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.24 
 
 
224 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  29 
 
 
226 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.23 
 
 
225 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1958  Crp/FNR family transcriptional regulator  29 
 
 
230 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0304498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1936  Crp/FNR family transcriptional regulator  29 
 
 
230 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.308171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2165  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29 
 
 
230 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3198  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.59 
 
 
221 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.90573 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.91 
 
 
243 aa  101  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.2 
 
 
240 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291012 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.45 
 
 
242 aa  101  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1063  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.07 
 
 
238 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.73 
 
 
236 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  22.39 
 
 
232 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.38 
 
 
224 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
231 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.11 
 
 
240 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948966  hitchhiker  0.00636029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0319  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
262 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
238 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.43 
 
 
231 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1975  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
230 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.29 
 
 
223 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
262 aa  99.4  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>