51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0752 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  536  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  95.56 
 
 		 270 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  34 
 
 		 406 aa  148  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.78 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0115  protein of unknown function DUF438  30.57 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  28.35 
 
 		 407 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  29.76 
 
 		 411 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  27.78 
 
 		 432 aa  94.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  29.39 
 
 		 395 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1718  hypothetical protein  29.3 
 
 		 485 aa  89.4  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  26.56 
 
 		 491 aa  89  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1746  putative PAS/PAC sensor protein  28.8 
 
 		 433 aa  87  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000524256  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  23.67 
 
 		 410 aa  85.9  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000266849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1800  putative PAS/PAC sensor protein  28.17 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  24.14 
 
 		 536 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.23 
 
 		 540 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0510  putative PAS/PAC sensor protein  25.53 
 
 		 532 aa  78.2  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0555672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.71 
 
 		 521 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00460  hypothetical protein  22.68 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3191  hypothetical protein  22.18 
 
 		 421 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3310  protein of unknown function DUF438  21.79 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.31 
 
 		 342 aa  67  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0141  hypothetical protein  22.92 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.546361 
 
 
-
 
NC_002950  PG0686  hypothetical protein  23.26 
 
 		 517 aa  60.5  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119299 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.27 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.61 
 
 		 184 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1545  putative PAS/PAC sensor protein  25.4 
 
 		 391 aa  55.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0699  hypothetical protein  31.52 
 
 		 146 aa  53.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1648  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.371191  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0661  putative PAS/PAC sensor protein  26.63 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2103  sensory box protein  26.63 
 
 		 321 aa  50.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.46 
 
 		 182 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2172  hypothetical protein  31.25 
 
 		 146 aa  49.3  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0485385  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.04 
 
 		 202 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3512  hemerythrin HHE cation binding protein  26.25 
 
 		 240 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0549925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3669  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.05 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3600  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.25 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5064  hemerythrin HHE cation binding region  28.26 
 
 		 141 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.650384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.16 
 
 		 202 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1838  hemerythrin HHE cation binding region  31.62 
 
 		 145 aa  46.2  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.42 
 
 		 202 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1891  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.85 
 
 		 152 aa  45.8  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4224  hypothetical protein  26.57 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0996  hemerythrin HHE cation binding region  30.95 
 
 		 148 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  29.8 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.69 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  25.16 
 
 		 201 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0493  hemerythrin HHE cation binding region  35.56 
 
 		 146 aa  43.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.2 
 
 		 185 aa  42.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02289  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30.77 
 
 		 223 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  30.32 
 
 		 188 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>