More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0749 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  100 
 
 
279 aa  571  1e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  98.21 
 
 
279 aa  563  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23290  transcriptional regulator, AraC family  36.4 
 
 
276 aa  152  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
278 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 
284 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 
273 aa  131  1e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3428  transcriptional regulator, AraC family  30.92 
 
 
265 aa  130  2e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1312  AraC family transcriptional regulator  27.65 
 
 
309 aa  112  9e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 
282 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0768  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 
261 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  27.07 
 
 
301 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  35.67 
 
 
300 aa  99.4  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  24.79 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  28.32 
 
 
273 aa  92.8  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.29156e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 
302 aa  92  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 
282 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.04 
 
 
298 aa  89  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  24.49 
 
 
310 aa  85.5  1e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  24.9 
 
 
325 aa  84.7  1e-15  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  26.23 
 
 
292 aa  85.1  1e-15  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
298 aa  85.1  1e-15  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  25.63 
 
 
306 aa  85.1  1e-15  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  3.09577e-06 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 
291 aa  84.3  2e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  20.8 
 
 
306 aa  82.8  6e-15  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  22.08 
 
 
314 aa  82  9e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01665  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.27 
 
 
303 aa  82  1e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0415  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 
288 aa  82  1e-14  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0125  transcriptional regulator, AraC family  25.11 
 
 
288 aa  81.3  1e-14  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1935  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
303 aa  82  1e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0147604 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01654  hypothetical protein  27.27 
 
 
303 aa  82  1e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0347  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 
288 aa  81.6  1e-14  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6879  transcriptional regulator, AraC family  24.26 
 
 
291 aa  80.9  2e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0489024  normal  0.393248 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5909  transcriptional regulator, AraC family  24.26 
 
 
291 aa  80.9  2e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1912  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
303 aa  80.9  2e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1899  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 
303 aa  80.9  2e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1946  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 
303 aa  80.9  2e-14  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.192766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1500  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 
303 aa  80.5  2e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.831009  normal  0.0187399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  22.13 
 
 
291 aa  80.1  4e-14  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2412  transcriptional regulator, AraC family  26.86 
 
 
303 aa  80.1  4e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.17 
 
 
309 aa  79  8e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.17 
 
 
292 aa  79  8e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.17 
 
 
292 aa  79  8e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  3.16606e-07 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.17 
 
 
292 aa  79  8e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.17 
 
 
292 aa  79  8e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 
292 aa  79  8e-14  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  26.17 
 
 
292 aa  79  8e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.35 
 
 
281 aa  79  9e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4772  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 
293 aa  79  9e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.78 
 
 
292 aa  77.8  2e-13  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  24.69 
 
 
300 aa  77.8  2e-13  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  23.81 
 
 
239 aa  77.4  2e-13  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 
310 aa  77  3e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  23.44 
 
 
315 aa  77  3e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  32.73 
 
 
332 aa  77  4e-13  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2431  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  25.96 
 
 
294 aa  76.6  4e-13  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.690566  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  37 
 
 
316 aa  76.3  5e-13  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  27.76 
 
 
285 aa  75.9  6e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3306  transcriptional regulator, AraC family  23.93 
 
 
275 aa  75.9  7e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.62 
 
 
281 aa  75.9  8e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3328  AraC family transcriptional regulator  23.93 
 
 
275 aa  75.5  9e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  23.17 
 
 
311 aa  75.5  9e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3030  AraC family transcriptional regulator  23.93 
 
 
275 aa  75.5  9e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  24.38 
 
 
327 aa  75.5  9e-13  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3086  AraC family transcriptional regulator  23.93 
 
 
275 aa  75.5  9e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.57264e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  24.14 
 
 
286 aa  74.7  1e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0936  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 
289 aa  74.7  1e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.352467  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  40.19 
 
 
519 aa  75.5  1e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.62 
 
 
281 aa  75.5  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1467  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 
296 aa  75.1  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.145729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.62 
 
 
281 aa  75.5  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
353 aa  75.1  1e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1817  transcriptional regulator, AraC family protein  26.97 
 
 
296 aa  75.1  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.246217  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1451  transcriptional regulator, AraC family protein  26.97 
 
 
296 aa  75.1  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0743909  normal  0.362871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.62 
 
 
281 aa  75.5  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3711  AraC family transcriptional regulator  24.58 
 
 
305 aa  75.1  1e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.62 
 
 
281 aa  75.5  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.21 
 
 
310 aa  74.3  2e-12  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.1 
 
 
310 aa  74.7  2e-12  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.21 
 
 
310 aa  74.3  2e-12  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.52 
 
 
280 aa  74.3  2e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1557  transcriptional regulator, AraC family  24.56 
 
 
349 aa  74.3  2e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150137  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  24.22 
 
 
316 aa  74.7  2e-12  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
254 aa  74.7  2e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4290  AraC family transcriptional regulator  25.33 
 
 
347 aa  73.9  2e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2924  AraC family transcriptional regulator  24.89 
 
 
349 aa  74.3  2e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817827  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54610  putative transcriptional regulator  24.58 
 
 
303 aa  73.9  3e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53981  normal  0.0153543 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  35.78 
 
 
519 aa  73.9  3e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 
1201 aa  73.9  3e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 
277 aa  73.9  3e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2126  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 
346 aa  73.6  3e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.330362  normal  0.517633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  24.69 
 
 
310 aa  73.9  3e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  39.05 
 
 
537 aa  73.2  4e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1424  AraC family transcriptional regulator  21.34 
 
 
280 aa  73.2  4e-12  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.46169  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 
286 aa  73.6  4e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6821  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 
324 aa  73.2  4e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  37.62 
 
 
367 aa  73.2  5e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 
367 aa  73.2  5e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.21 
 
 
310 aa  73.2  5e-12  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  24.58 
 
 
342 aa  72.8  6e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>