253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0748 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  98.9 
 
 
454 aa  899    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  100 
 
 
454 aa  907    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.95 
 
 
476 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  30.72 
 
 
467 aa  222  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  31.75 
 
 
443 aa  219  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  29.63 
 
 
461 aa  213  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1583  glucuronide transporter  30.77 
 
 
457 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.04 
 
 
463 aa  209  9e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  30.55 
 
 
457 aa  209  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  32.82 
 
 
441 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2327  glucuronide transporter  30.33 
 
 
457 aa  207  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  30.33 
 
 
457 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  30.33 
 
 
457 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  30.11 
 
 
457 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  30.11 
 
 
457 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  32.15 
 
 
441 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  32.15 
 
 
442 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2026  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.22 
 
 
457 aa  203  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  27.9 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.93 
 
 
441 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.35 
 
 
448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.29 
 
 
475 aa  199  6e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.18 
 
 
442 aa  196  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0071  melibiose:sodium symporter  29.55 
 
 
448 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  29.37 
 
 
442 aa  193  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.98 
 
 
471 aa  190  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.22 
 
 
442 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1454  sugar transporter  30.27 
 
 
454 aa  186  7e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0020  xylose-proton symporter  28.41 
 
 
457 aa  186  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000106497  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  29.89 
 
 
476 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  29.89 
 
 
476 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  29.89 
 
 
476 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  29.89 
 
 
476 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.93 
 
 
472 aa  185  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2372  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  31.94 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  29.66 
 
 
476 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  29 
 
 
462 aa  184  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.48 
 
 
442 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1193  Na+/xyloside symporter or related transporter  28.57 
 
 
437 aa  182  8.000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0776  Zinc finger-domain-containing protein  30.82 
 
 
447 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0781581 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.73 
 
 
460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.47 
 
 
468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.77 
 
 
444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.81 
 
 
478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  28.95 
 
 
459 aa  180  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0781  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.57 
 
 
474 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0195  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.57 
 
 
474 aa  179  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0477575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0709  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.57 
 
 
474 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.64 
 
 
465 aa  179  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  28.07 
 
 
481 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  29.04 
 
 
465 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  28.07 
 
 
473 aa  179  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  28.07 
 
 
473 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  28.07 
 
 
473 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1935  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.99 
 
 
461 aa  178  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  27.97 
 
 
469 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  27.97 
 
 
469 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  28.07 
 
 
481 aa  176  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.97 
 
 
469 aa  176  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  26.54 
 
 
462 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1245  Na+/xyloside symporter related transporter  28.6 
 
 
467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.37 
 
 
478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  31.25 
 
 
471 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.04 
 
 
481 aa  173  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.04 
 
 
481 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.06 
 
 
481 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  27.98 
 
 
468 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  27.53 
 
 
468 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  27.53 
 
 
468 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  27.53 
 
 
468 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  27.53 
 
 
468 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  28.35 
 
 
479 aa  170  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  28.35 
 
 
479 aa  170  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.27 
 
 
477 aa  170  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0046  xylose-proton symporter  28.7 
 
 
471 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00152296  normal  0.141953 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0047  xylose-proton symporter  28.7 
 
 
471 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0046  xylose-proton symporter  28.7 
 
 
457 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00338984  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4249  inner membrane symporter YihP  27.07 
 
 
460 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0047  xylose-proton symporter  28.7 
 
 
457 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000774004  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4294  inner membrane symporter YihP  27.07 
 
 
460 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4340  inner membrane symporter YihP  27.07 
 
 
460 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  28.29 
 
 
460 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4406  inner membrane symporter YihP  26.46 
 
 
460 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0907861  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4228  inner membrane symporter YihP  26.46 
 
 
460 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.29 
 
 
460 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  26.67 
 
 
442 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  28.35 
 
 
479 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  28.29 
 
 
460 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.320086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  28.29 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  28.29 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  28.29 
 
 
460 aa  167  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5323  sugar transporter family protein  25.39 
 
 
461 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.02 
 
 
471 aa  167  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.99 
 
 
465 aa  166  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03762  predicted transporter  25.17 
 
 
468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4109  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.17 
 
 
461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03711  hypothetical protein  25.17 
 
 
468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.42 
 
 
466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4394  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.19 
 
 
444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0181186  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4400  sugar transporter family protein  24.94 
 
 
468 aa  163  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>