33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0733 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  872  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  40.99 
 
 
445 aa  313  4e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.80978e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  37.56 
 
 
458 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  34 
 
 
449 aa  223  5e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  24.84 
 
 
435 aa  66.6  7e-10  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  23.94 
 
 
438 aa  59.3  1e-07  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  29.92 
 
 
433 aa  57.8  3e-07  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  23.31 
 
 
426 aa  58.2  3e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  29.37 
 
 
447 aa  57.4  5e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  25.37 
 
 
432 aa  56.2  1e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  20.79 
 
 
451 aa  53.5  8e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  22.66 
 
 
428 aa  52.4  1e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  27.87 
 
 
422 aa  51.6  3e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  28.03 
 
 
394 aa  51.2  4e-05  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.25466e-08 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  29.17 
 
 
405 aa  50.4  7e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  28.68 
 
 
435 aa  50.4  7e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  25.81 
 
 
459 aa  50.4  7e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  30.82 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  26.89 
 
 
421 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  25.19 
 
 
407 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  30.23 
 
 
400 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  47.37 
 
 
359 aa  47  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  25 
 
 
422 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  24.6 
 
 
407 aa  46.6  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  26.67 
 
 
425 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1824  DNA repair ATPase  29.63 
 
 
495 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  28.03 
 
 
431 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  21.05 
 
 
456 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  19.36 
 
 
394 aa  45.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  25.55 
 
 
440 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  22.43 
 
 
429 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  30.86 
 
 
380 aa  43.5  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  27.91 
 
 
422 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>