More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0679 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0126  ISCpe2, transposase orfB  97.66 
 
 
384 aa  769    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  97.92 
 
 
384 aa  773    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  97.92 
 
 
384 aa  772    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0472  ISCpe2, transposase orfB  97.66 
 
 
384 aa  770    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  97.92 
 
 
384 aa  771    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  97.92 
 
 
384 aa  772    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  100 
 
 
384 aa  788    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  97.14 
 
 
384 aa  769    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0723  ISCpe2, transposase orfB  97.66 
 
 
384 aa  770    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  96.87 
 
 
383 aa  763    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  97.66 
 
 
384 aa  769    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  98.18 
 
 
384 aa  774    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  97.92 
 
 
384 aa  774    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1049  ISCpe2, transposase orfB  97.4 
 
 
384 aa  766    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00154487  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  96.61 
 
 
384 aa  763    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  96.61 
 
 
384 aa  766    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0505  ISCpe2, transposase orfB  97.03 
 
 
236 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  52.63 
 
 
373 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  51.58 
 
 
373 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  51.84 
 
 
373 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  51.86 
 
 
372 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  51.6 
 
 
372 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  51.86 
 
 
372 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  51.33 
 
 
372 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  51.32 
 
 
373 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  50.79 
 
 
373 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  50.79 
 
 
373 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  50.79 
 
 
373 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  51.54 
 
 
383 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  51.54 
 
 
383 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  51.41 
 
 
383 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  48.67 
 
 
370 aa  359  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  48.4 
 
 
370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0407  ISCpe2, transposase orfB  100 
 
 
164 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0008  family transposase  48.94 
 
 
332 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  44.7 
 
 
440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0042  transposase  45 
 
 
362 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.580929  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2515  transposase, IS605 OrfB family  48.86 
 
 
326 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  40.21 
 
 
372 aa  281  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2479  transposase, IS605 OrfB family  41.54 
 
 
388 aa  280  4e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  39.73 
 
 
383 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  39.73 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  39.73 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  39.73 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  42.04 
 
 
370 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  41.78 
 
 
370 aa  272  7e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  38.93 
 
 
383 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  40.84 
 
 
370 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  40.8 
 
 
383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  39.73 
 
 
383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  39.73 
 
 
383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  38.67 
 
 
383 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  41.56 
 
 
370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  42.3 
 
 
370 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  42.6 
 
 
393 aa  268  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0404  transposase  53.04 
 
 
259 aa  266  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  40.99 
 
 
370 aa  266  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  41.36 
 
 
370 aa  265  7e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  41.25 
 
 
393 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  41.51 
 
 
370 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  40.73 
 
 
370 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0506  ISCpe2, transposase orfB  96.12 
 
 
129 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  40.21 
 
 
394 aa  259  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  40.83 
 
 
405 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  38.97 
 
 
368 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  37.53 
 
 
410 aa  256  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  37.79 
 
 
377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  36.5 
 
 
405 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2736  transposase, IS605 OrfB family  36.53 
 
 
391 aa  250  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.312474 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  37.89 
 
 
408 aa  249  8e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  39.05 
 
 
384 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.04 
 
 
381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  37.53 
 
 
403 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1501  transposase  35.68 
 
 
397 aa  246  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.915709  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  37.53 
 
 
403 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  37.53 
 
 
403 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  37.53 
 
 
403 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1093  transposase  35.43 
 
 
397 aa  245  6.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.946066  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  38.05 
 
 
402 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.86 
 
 
381 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  38.05 
 
 
402 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  38.05 
 
 
402 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  41.24 
 
 
403 aa  243  3e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  37.99 
 
 
399 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  35.48 
 
 
410 aa  242  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  36.6 
 
 
373 aa  243  6e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  36.51 
 
 
416 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  37.82 
 
 
377 aa  242  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  37.02 
 
 
403 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1623  IS605 family transposase OrfB  37.09 
 
 
391 aa  242  7.999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  45 
 
 
304 aa  242  9e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  36.62 
 
 
391 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  37.28 
 
 
377 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.4 
 
 
376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  36.76 
 
 
405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  37.37 
 
 
375 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  38.32 
 
 
396 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0227  IS605 family transposase OrfB  36.84 
 
 
391 aa  238  1e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0173812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  35.23 
 
 
381 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  35.51 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>