32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0636 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0640  hypothetical protein  99.6 
 
 
506 aa  1025    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0171337  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0636  hypothetical protein  100 
 
 
497 aa  1027    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1776  hypothetical protein  59.92 
 
 
495 aa  615  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000652545  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1577  hypothetical protein  51.3 
 
 
514 aa  518  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0136  hypothetical protein  40.88 
 
 
500 aa  411  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.619185  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3943  hypothetical protein  40.59 
 
 
517 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1873  hypothetical protein  38.59 
 
 
515 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.406641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3618  conserved hypothetical protein  39.48 
 
 
516 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4978  hypothetical protein  39.48 
 
 
516 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4615  hypothetical protein  39.48 
 
 
516 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4928  hypothetical protein  39.68 
 
 
516 aa  378  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04222  hypothetical protein  39.48 
 
 
516 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177714  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4981  hypothetical protein  39.48 
 
 
516 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.986087  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4888  hypothetical protein  39.48 
 
 
516 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00183026  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4820  hypothetical protein  39.48 
 
 
516 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4974  hypothetical protein  39.28 
 
 
516 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.164186  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4922  hypothetical protein  39.48 
 
 
516 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573575  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0271  hypothetical protein  39.8 
 
 
523 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000729096 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3676  hypothetical protein  39.48 
 
 
516 aa  378  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0063204 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04256  hypothetical protein  39.48 
 
 
516 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137838  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0268  hypothetical protein  39.51 
 
 
517 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00938119 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0540  hypothetical protein  39.24 
 
 
515 aa  378  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00218193  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02540  hypothetical protein  39.96 
 
 
514 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2066  hypothetical protein  39.8 
 
 
516 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2407  hypothetical protein  38.96 
 
 
519 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003580  hypothetical protein  38.93 
 
 
514 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1985  hypothetical protein  39.21 
 
 
522 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2283  hypothetical protein  39.08 
 
 
520 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.02604  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2400  hypothetical protein  38.89 
 
 
516 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0516423  unclonable  0.0000100852 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2062  hypothetical protein  38.78 
 
 
520 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000491691 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  27.01 
 
 
786 aa  49.3  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2406  formate acetyltransferase  22.03 
 
 
760 aa  44.3  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>