74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0635 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0635  ISCpe7, transposase  100 
 
 
186 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0929  ISCpe7, transposase  97.85 
 
 
186 aa  381  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0298408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  97.8 
 
 
253 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  97.8 
 
 
340 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  97.25 
 
 
340 aa  374  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  97.8 
 
 
340 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  97.8 
 
 
340 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  97.8 
 
 
340 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  97.25 
 
 
340 aa  374  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  97.25 
 
 
340 aa  374  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  96.7 
 
 
340 aa  367  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1189  ISCpe7, transposase  97.37 
 
 
152 aa  306  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  45.05 
 
 
343 aa  169  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000147635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  45.55 
 
 
353 aa  164  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  45.55 
 
 
353 aa  164  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  45.55 
 
 
353 aa  164  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  45.55 
 
 
353 aa  164  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1065  Integrase catalytic region  43.98 
 
 
353 aa  161  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.106559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1912  Integrase catalytic region  43.98 
 
 
353 aa  161  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0243  Integrase catalytic region  43.98 
 
 
353 aa  161  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0037  Integrase catalytic region  43.98 
 
 
353 aa  161  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2179  Integrase catalytic region  43.98 
 
 
353 aa  161  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521095  hitchhiker  1.88153e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2243  Integrase catalytic region  43.98 
 
 
353 aa  161  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.781166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2409  Integrase catalytic region  43.98 
 
 
353 aa  161  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0556  ISCpe7, transposase  35.98 
 
 
312 aa  84  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0422  insertion element protein  35.98 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1361  ISCpe7, transposase  35.98 
 
 
312 aa  84  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0203024  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0115  hypothetical protein  35.98 
 
 
261 aa  84  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0727  insertion element protein  35.98 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0799  ISCpe7, transposase  35.98 
 
 
312 aa  84  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0903  ISCpe7, transposase  35.98 
 
 
312 aa  84  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000597662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1164  ISCpe7, transposase  35.98 
 
 
312 aa  84  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0030  insertion element protein  35.98 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000855614  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1581  ISCpe7, transposase  35.98 
 
 
312 aa  84  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0078  ISCpe7, transposase  35.98 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.516266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1196  ISCpe7, transposase  35.98 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0337  ISCpe7, transposase  35.98 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.500965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0386  hypothetical protein  35.98 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1574  ISCpe7, transposase  35.37 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0509  ISCpe7, transposase  35.37 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0035  ISCpe7, transposase  31.52 
 
 
316 aa  79  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.800546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1261  ISCpe7, transposase  31.52 
 
 
316 aa  79  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1078  ISCpe7, transposase  31.52 
 
 
316 aa  79  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0745  ISCpe7, transposase  31.52 
 
 
316 aa  79  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000815737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0315  ISCpe7, transposase  31.52 
 
 
316 aa  79  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00611234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1412  ISCpe7, transposase  31.52 
 
 
316 aa  79  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2900  hypothetical protein  35.06 
 
 
108 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0226178 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0539  transposase  23.08 
 
 
478 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000512999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0694  transposase  23.08 
 
 
478 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000208331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2050  transposase  23.08 
 
 
478 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0319  transposase  22.56 
 
 
470 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1444  putative transposase  47.5 
 
 
108 aa  45.1  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1621  hypothetical protein  25.81 
 
 
334 aa  43.5  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  33.9 
 
 
236 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  33.9 
 
 
236 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  33.9 
 
 
237 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  33.9 
 
 
262 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  32.95 
 
 
233 aa  42.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1015  transposase  39.29 
 
 
134 aa  42  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.653024  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  32.95 
 
 
233 aa  42.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  31.82 
 
 
233 aa  42  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  31.82 
 
 
233 aa  42  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3317  hypothetical protein  41.82 
 
 
469 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  31.82 
 
 
233 aa  42  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1938  IS1 transposase  50 
 
 
233 aa  42  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1525  IS1 transposase  50 
 
 
233 aa  42  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0700  IS1 transposase  50 
 
 
233 aa  42  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0265  IS1 transposase  50 
 
 
233 aa  42  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.878281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  32.2 
 
 
236 aa  41.6  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  33.73 
 
 
236 aa  41.2  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  33.73 
 
 
236 aa  41.6  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  33.73 
 
 
236 aa  41.2  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  32.2 
 
 
211 aa  41.2  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  32.2 
 
 
237 aa  40.8  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>