57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0631 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0631  bacteriocin  100 
 
 
356 aa  725    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.420339  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  73.22 
 
 
1067 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0001  bacteriocin  49.54 
 
 
879 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  43.94 
 
 
550 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  36.36 
 
 
573 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  38.89 
 
 
418 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.48 
 
 
553 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  48.08 
 
 
578 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  45.45 
 
 
420 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  45.45 
 
 
420 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  45.45 
 
 
420 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  45.45 
 
 
420 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  45.45 
 
 
413 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1245  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  39.73 
 
 
969 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0232944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  44.64 
 
 
426 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  45.45 
 
 
420 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  45.45 
 
 
432 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  44.64 
 
 
426 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  31.09 
 
 
341 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  36.54 
 
 
556 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  46.15 
 
 
582 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  46.15 
 
 
579 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  46.15 
 
 
577 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.15 
 
 
580 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  46.15 
 
 
582 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  46.15 
 
 
598 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1439  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  34.69 
 
 
1049 aa  49.7  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00896108  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  46.15 
 
 
582 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.25 
 
 
476 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0610  peptidase M23B  48.98 
 
 
383 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000136568  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  40 
 
 
553 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  47.06 
 
 
536 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  40.91 
 
 
549 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  43.64 
 
 
430 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  26.14 
 
 
564 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4552  peptidase, M23/M37 family  46.94 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000312233  normal  0.0469454 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
575 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  26.14 
 
 
564 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  26.14 
 
 
564 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  39.62 
 
 
377 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  27.83 
 
 
564 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.65 
 
 
907 aa  47  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0779  peptidase, M23/M37 family  46.94 
 
 
384 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0000701566  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  26.14 
 
 
564 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0640  peptidase M23B  46.94 
 
 
386 aa  46.6  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000535366  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  44.44 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0794  M24/M37 family peptidase  44.9 
 
 
384 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000011526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0690  M24/M37 family peptidase  44.9 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000234103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0801  peptidase, M23/M37 family  44.9 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70657e-48 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  44.9 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.2041900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  44.9 
 
 
386 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000528425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0724  M23/37 family peptidase  44.9 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000754893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0876  peptidase, M23/M37 family  44.9 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  37.88 
 
 
298 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1630  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  40.91 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.883848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  34.67 
 
 
296 aa  43.9  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3124  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36 
 
 
471 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>