109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0611 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0611  flavodoxin  100 
 
 
138 aa  276  8e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  1.66684e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0625  flavodoxin  99.28 
 
 
138 aa  275  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  7.60525e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0878  flavodoxin  45.32 
 
 
141 aa  131  4e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  1.47271e-10  hitchhiker  4.57533e-10 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10970  flavodoxin, short chain  42.75 
 
 
140 aa  126  1e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.695336  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0741  flavodoxin  48.57 
 
 
143 aa  120  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  9.52675e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2335  flavodoxin  43.8 
 
 
143 aa  120  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0460226  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0306  flavodoxin  39.86 
 
 
140 aa  116  1e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10550  flavodoxin  43.44 
 
 
138 aa  114  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.66054e-06  hitchhiker  1.16107e-08 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1456  flavodoxin  38.13 
 
 
143 aa  112  1e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2033  flavodoxin  41.73 
 
 
141 aa  110  8e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2319  flavodoxin  41.73 
 
 
141 aa  110  8e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0163  flavodoxin  39.16 
 
 
145 aa  110  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0964  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.55 
 
 
134 aa  102  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0186557  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0356  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.51 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.40053e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2071  flavodoxin  30.15 
 
 
156 aa  62  3e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.785736  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1095  flavodoxin  35.21 
 
 
148 aa  60.1  9e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1369  flavin reductase-like, FMN-binding  30.71 
 
 
575 aa  59.7  1e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.018202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  31.97 
 
 
423 aa  58.2  4e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3916  flavodoxin  33.57 
 
 
148 aa  57.4  6e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1290  flavodoxin  33.57 
 
 
148 aa  57.4  6e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1262  flavodoxin  33.57 
 
 
148 aa  57.4  6e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1428  flavodoxin  33.57 
 
 
148 aa  57.4  6e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1264  flavodoxin  33.57 
 
 
148 aa  57.4  6e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1465  flavodoxin  33.57 
 
 
148 aa  57.4  6e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1534  flavodoxin  33.57 
 
 
148 aa  57.4  7e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1298  flavodoxin  33.57 
 
 
148 aa  57  9e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1375  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  31.03 
 
 
616 aa  56.6  1e-07  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1492  flavodoxin  35.21 
 
 
148 aa  56.6  1e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00561  flavoprotein  30.97 
 
 
500 aa  56.2  2e-07  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 
576 aa  55.5  3e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 
395 aa  53.9  7e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.74578e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  30.82 
 
 
396 aa  51.6  3e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.65819e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 
397 aa  51.6  4e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.25791e-05  hitchhiker  6.1463e-07 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3606  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
571 aa  48.9  2e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2508  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
571 aa  48.9  2e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00548626  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.6 
 
 
160 aa  48.9  2e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2408  flavodoxin FldA  30.77 
 
 
160 aa  48.1  4e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1394  flavodoxin  31.78 
 
 
138 aa  47.8  5e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3173  flavodoxin FldA  32.61 
 
 
160 aa  47.4  6e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1810  flavoprotein  26.57 
 
 
584 aa  47.4  6e-05  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.361891  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2183  putative flavoprotein  29.2 
 
 
598 aa  47.8  6e-05  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0076  flavodoxin FldA  32.61 
 
 
160 aa  47  8e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.326568  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1951  flavodoxin  30 
 
 
148 aa  47  8e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  4.25319e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2656  flavodoxin FldA  32.76 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 
387 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.87 
 
 
500 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  30.28 
 
 
403 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  31.03 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0379  flavodoxin FldA  31.4 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  28.87 
 
 
404 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1859  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.2 
 
 
585 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00471  flavoprotein  26.76 
 
 
613 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.818961  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00431  flavoprotein  24.46 
 
 
600 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.175879  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00491  flavoprotein  26.72 
 
 
600 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0334282  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.66 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36317  predicted protein  29.66 
 
 
588 aa  44.3  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0043  flavoprotein  25.86 
 
 
593 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1269  flavodoxin FldA  37.21 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.829769  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  28.79 
 
 
399 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  7.05459e-05 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0110  flavodoxin FldA  32.17 
 
 
162 aa  43.9  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  26.76 
 
 
399 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.29 
 
 
499 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.17 
 
 
504 aa  42.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  30.71 
 
 
392 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28831  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  28.45 
 
 
615 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00451  flavoprotein  25.86 
 
 
600 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
395 aa  42  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.27 
 
 
503 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  28.21 
 
 
399 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1929  flavodoxin FldA  33.57 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.27 
 
 
505 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  41.3 
 
 
199 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.09 
 
 
156 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0805  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.14 
 
 
573 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
395 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1207  flavodoxin FldA  30.58 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  5.63354e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1237  flavodoxin  31.71 
 
 
179 aa  41.2  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.41409e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0834  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.43 
 
 
573 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.293861  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18090  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.236562  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4352  TrpR binding protein WrbA  41.3 
 
 
199 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.24 
 
 
493 aa  40.8  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5226  TrpR binding protein WrbA  41.3 
 
 
203 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.57 
 
 
494 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2485  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 
198 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0340  flavodoxin/nitric oxide synthase  30 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.687368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2810  TrpR binding protein WrbA  41.3 
 
 
199 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0459  flavodoxin  25.18 
 
 
161 aa  40.4  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.728762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.27 
 
 
202 aa  40.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.06 
 
 
479 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.06 
 
 
479 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  26.43 
 
 
392 aa  40.8  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.06 
 
 
479 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.06 
 
 
479 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0539  flavodoxin  27.34 
 
 
147 aa  40.4  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  7.06098e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  26.06 
 
 
479 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.06 
 
 
479 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3743  protoporphyrinogen oxidase  29.03 
 
 
179 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  5.14113e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  32.53 
 
 
188 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  29.59 
 
 
178 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  43.48 
 
 
199 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>