65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0597 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  100 
 
 		 434 aa  882    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  68.61 
 
 		 430 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  66.82 
 
 		 891 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  54.7 
 
 		 573 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  66.67 
 
 		 552 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  36.55 
 
 		 651 aa  155  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  34.9 
 
 		 330 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  38 
 
 		 550 aa  145  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  33.04 
 
 		 2495 aa  144  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  33.13 
 
 		 602 aa  141  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  37.22 
 
 		 613 aa  134  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  32.67 
 
 		 454 aa  133  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  34.26 
 
 		 532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  34.85 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  34.29 
 
 		 807 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  37.44 
 
 		 512 aa  121  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  35.89 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  35.97 
 
 		 757 aa  118  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  38.51 
 
 		 502 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  30.65 
 
 		 316 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 753 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  32.78 
 
 		 750 aa  110  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  32.33 
 
 		 1557 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  31.2 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  32.74 
 
 		 811 aa  96.3  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  33.33 
 
 		 578 aa  92.8  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  32.23 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 377 aa  92.8  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  32.31 
 
 		 592 aa  90.9  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  40.58 
 
 		 302 aa  89.7  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  27.85 
 
 		 817 aa  85.1  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  29.38 
 
 		 697 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.13 
 
 		 762 aa  79.7  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  26.64 
 
 		 589 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  33.09 
 
 		 271 aa  75.9  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.23 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  30.67 
 
 		 465 aa  73.6  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  26.17 
 
 		 1131 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  26.17 
 
 		 1131 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  31.91 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1467  putative enterotoxin  33.33 
 
 		 947 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1266  putative enterotoxin  33.33 
 
 		 956 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  26.97 
 
 		 890 aa  66.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  44.3 
 
 		 1732 aa  64.3  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  26.64 
 
 		 1363 aa  62  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  27.13 
 
 		 532 aa  61.2  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  27.89 
 
 		 587 aa  60.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  30.56 
 
 		 2821 aa  59.3  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  40.91 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  24.75 
 
 		 184 aa  56.2  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  23.02 
 
 		 737 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  26.5 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  24.12 
 
 		 1527 aa  50.4  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.42 
 
 		 339 aa  50.4  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.83 
 
 		 399 aa  50.1  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  28.49 
 
 		 1475 aa  47.8  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1002 aa  47.4  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  25.14 
 
 		 474 aa  46.6  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.35 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.56 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0022042  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1009 aa  46.6  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0535  YG repeat-containing cell wall-associated hydrolase  29.75 
 
 		 292 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1573  metallo-beta-lactamase family protein  24 
 
 		 626 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  29.94 
 
 		 1514 aa  44.3  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1025 aa  43.5  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>