63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0591 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  100 
 
 		 573 aa  1153    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  53.14 
 
 		 550 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  67.45 
 
 		 552 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  54.7 
 
 		 434 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  62.22 
 
 		 891 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0001  bacteriocin  44.77 
 
 		 879 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  36.93 
 
 		 602 aa  182  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  41.45 
 
 		 1067 aa  181  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  31.13 
 
 		 651 aa  163  8.000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  34.94 
 
 		 330 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  34.93 
 
 		 532 aa  148  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  36.21 
 
 		 613 aa  147  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  37.62 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  31.72 
 
 		 430 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  35.9 
 
 		 807 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  35.68 
 
 		 2495 aa  129  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  29.61 
 
 		 316 aa  129  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  29.22 
 
 		 753 aa  128  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  32.52 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  32.05 
 
 		 757 aa  120  7.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  40.76 
 
 		 478 aa  116  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  36.46 
 
 		 502 aa  115  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  31.65 
 
 		 324 aa  114  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  35.12 
 
 		 302 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  32.54 
 
 		 750 aa  107  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  30.56 
 
 		 331 aa  107  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  31.94 
 
 		 811 aa  105  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.85 
 
 		 762 aa  99  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  31.62 
 
 		 592 aa  95.5  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  35.47 
 
 		 342 aa  95.1  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  27.74 
 
 		 1557 aa  94.7  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  30.33 
 
 		 377 aa  91.7  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0631  bacteriocin  36.67 
 
 		 356 aa  87.8  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.420339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  28.81 
 
 		 465 aa  87  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  31.03 
 
 		 817 aa  84.3  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  35.86 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  29.38 
 
 		 697 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  32.34 
 
 		 578 aa  78.6  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  29.22 
 
 		 1131 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  29.22 
 
 		 1131 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  33.33 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  26.37 
 
 		 589 aa  74.7  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  27.72 
 
 		 737 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  28.81 
 
 		 2821 aa  65.9  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  25.69 
 
 		 890 aa  66.2  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.68 
 
 		 350 aa  66.2  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  27.3 
 
 		 532 aa  63.2  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.58 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  25.57 
 
 		 1363 aa  60.5  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  28.1 
 
 		 587 aa  59.7  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  30.63 
 
 		 1732 aa  59.3  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  34.58 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  25.4 
 
 		 1475 aa  56.2  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1002 aa  54.7  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  25.56 
 
 		 1527 aa  54.3  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.5 
 
 		 399 aa  53.9  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  23.68 
 
 		 1514 aa  53.5  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1009 aa  53.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.72 
 
 		 514 aa  51.2  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0022042  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  22.97 
 
 		 420 aa  50.8  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1025 aa  49.7  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  29.75 
 
 		 184 aa  46.6  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>