63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0591 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  100 
 
 
573 aa  1153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.59659e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  53.14 
 
 
550 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  67.45 
 
 
552 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  54.7 
 
 
434 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  62.22 
 
 
891 aa  285  2e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0001  bacteriocin  44.77 
 
 
879 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  36.93 
 
 
602 aa  182  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  41.45 
 
 
1067 aa  181  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  31.13 
 
 
651 aa  163  8e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  34.94 
 
 
330 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  34.93 
 
 
532 aa  148  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  36.21 
 
 
613 aa  147  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  37.62 
 
 
512 aa  132  2e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  31.72 
 
 
430 aa  130  7e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  35.9 
 
 
807 aa  129  1e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  35.68 
 
 
2495 aa  129  2e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  29.61 
 
 
316 aa  129  2e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.72933e-07 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  29.22 
 
 
753 aa  128  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  3.30124e-05  hitchhiker  1.07499e-11 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  32.52 
 
 
454 aa  127  4e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  32.05 
 
 
757 aa  120  8e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  40.76 
 
 
478 aa  116  9e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  36.46 
 
 
502 aa  115  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  31.65 
 
 
324 aa  114  4e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  32.54 
 
 
750 aa  107  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  35.12 
 
 
302 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  30.56 
 
 
331 aa  107  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  31.94 
 
 
811 aa  105  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.85 
 
 
762 aa  99  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  31.62 
 
 
592 aa  95.5  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  35.47 
 
 
342 aa  95.1  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  27.74 
 
 
1557 aa  94.7  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  30.33 
 
 
377 aa  91.7  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0631  bacteriocin  36.67 
 
 
356 aa  87.8  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.420339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  28.81 
 
 
465 aa  87  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  31.03 
 
 
817 aa  84.3  6e-15  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  35.86 
 
 
440 aa  82  2e-14  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  29.38 
 
 
697 aa  81.6  3e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  32.34 
 
 
578 aa  78.6  3e-13  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  29.22 
 
 
1131 aa  76.6  1e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  3.20353e-07 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  29.22 
 
 
1131 aa  76.6  1e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  33.33 
 
 
271 aa  75.1  3e-12  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  26.37 
 
 
589 aa  74.7  4e-12  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  27.72 
 
 
737 aa  68.6  3e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.68 
 
 
350 aa  66.2  2e-09  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  25.69 
 
 
890 aa  66.2  2e-09  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  8.52469e-05  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  28.81 
 
 
2821 aa  65.9  2e-09  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  27.3 
 
 
532 aa  63.2  1e-08  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.58 
 
 
339 aa  61.6  4e-08  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  5.61164e-06 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  25.57 
 
 
1363 aa  60.5  9e-08  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  28.1 
 
 
587 aa  59.7  2e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  30.63 
 
 
1732 aa  59.3  2e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28 
 
 
399 aa  58.2  4e-07  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  2.19862e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  34.58 
 
 
203 aa  57.8  5e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  25.4 
 
 
1475 aa  56.2  1e-06  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  25.77 
 
 
1002 aa  54.7  4e-06  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  25.56 
 
 
1527 aa  54.3  7e-06  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.5 
 
 
399 aa  53.9  9e-06  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  3.03579e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  23.68 
 
 
1514 aa  53.5  1e-05  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  26.6 
 
 
1009 aa  53.1  1e-05  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.72 
 
 
514 aa  51.2  5e-05  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0022042  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  22.97 
 
 
420 aa  50.8  7e-05  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  25.5 
 
 
1025 aa  49.7  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  29.75 
 
 
184 aa  46.6  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>