More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0539 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  94.9 
 
 		 529 aa  949    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  100 
 
 		 529 aa  1031    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  28.8 
 
 		 546 aa  154  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  28.05 
 
 		 538 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  25.88 
 
 		 532 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 522 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0147  two component transcriptional regulator, AraC family  26.53 
 
 		 525 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2055  two component transcriptional regulator, AraC family  27.21 
 
 		 519 aa  133  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3249  two component transcriptional regulator, AraC family  24.13 
 
 		 531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0314  two component transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 		 494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 532 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  25.23 
 
 		 507 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  25.23 
 
 		 507 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1394  two component AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 523 aa  120  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  24.55 
 
 		 530 aa  117  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  22.55 
 
 		 539 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2007  two component AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 529 aa  106  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2452  two component transcriptional regulator, AraC family  41.22 
 
 		 509 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0693402  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1251  two component transcriptional regulator, AraC family  24.87 
 
 		 566 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0149  two component transcriptional regulator, AraC family  22.81 
 
 		 525 aa  95.1  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2406  AraC family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 251 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 532 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 414 aa  87.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0125  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 288 aa  87.4  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0207  response regulator receiver protein  31.08 
 
 		 252 aa  87  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0213  response regulator receiver  31.08 
 
 		 252 aa  87  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 543 aa  86.7  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  41.41 
 
 		 537 aa  86.7  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 506 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 535 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.05 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  36.13 
 
 		 502 aa  84.7  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 544 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 215 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  36.3 
 
 		 250 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 215 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 215 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  28.31 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 285 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 250 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  29.56 
 
 		 519 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  28.08 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  38.1 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  32.35 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3034  two component AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 556 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00618221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 355 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 215 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  31.44 
 
 		 542 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 215 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 232 aa  79.7  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 215 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.45 
 
 		 232 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 215 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 215 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  29.69 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.21 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  31.88 
 
 		 526 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2141  two component AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5499  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00659712  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3211  two component AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 548 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1146  response regulator receiver  36.19 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3615  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.72 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.176603 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  29.59 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  28.3 
 
 		 210 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  29.59 
 
 		 215 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 215 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  31.16 
 
 		 391 aa  76.6  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  29.59 
 
 		 215 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  36.51 
 
 		 773 aa  76.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 215 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 760 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  29.59 
 
 		 215 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 291 aa  76.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  29.59 
 
 		 215 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1351  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 141 aa  75.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000171187  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 273 aa  75.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  30.59 
 
 		 282 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0876  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 259 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  28.99 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  27.4 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 223 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 119 aa  74.7  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>