More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0473 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0473  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0229  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0489  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.107964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0228  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.883109  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0093  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0094  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0095  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0096  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0097  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0074  tRNA-Met  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0141721  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0036  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2792  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000935283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2795  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000169803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2478  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00948036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2481  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000303707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0014  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000138583  hitchhiker  0.00843441 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0035  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0027  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0073  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000821998  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0026  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0055  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0084  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0249486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0063  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00364456  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0031  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0036  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0037  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0025  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0012  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0024  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t058  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0442009  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0083  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000703171  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0088  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-3  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-4  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.567742  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-5  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Met-3  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.390156  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0633  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.811273  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt019  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00289748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0025  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0048  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00409102  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3203t  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3199t  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.976924  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3201t  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3197t  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0021  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.114788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1598  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050926  normal  0.567134 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0033  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0177  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.202779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0076  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.195191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0074  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0044  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3828  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0056  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0075  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2621  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t027  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t54  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.243475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0390  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3081  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA21  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.929438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA22  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0039  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0436606  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0038  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0258342  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0052  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.902877 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1813  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1829  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0055  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.867908 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0054  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.871356 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0053  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.896198 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1857  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2507  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0046  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0057  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.88568 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0034  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0047  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.808514  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2238  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869817  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1732  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0037  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0436606  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0036  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0763298  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0081  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.681899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0054  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.965262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0068  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.347514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0076  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00786304  normal  0.218816 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0007  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0031  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0043  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0079  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0076  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0631311  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0077  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0627424  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0078  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0634809  normal  0.33041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0079  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.060888  normal  0.335766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0058  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0046  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0060  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0772  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0060  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00315069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1510  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>