15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0463 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0463  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000202427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0603  hypothetical protein  45.74 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000500963  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12360  LICD family protein  27.96 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0296  hypothetical protein  27.31 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.840944  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2618  hypothetical protein  37.36 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1451  methyltransferase type 11  25.52 
 
 		 523 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.182574  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1750  LPS biosynthesis protein-like protein  50 
 
 		 338 aa  47  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0890  LicD family protein  22.28 
 
 		 454 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.147531 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0589  LicD family protein  46 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000965792  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1746  LicD family protein  54.55 
 
 		 319 aa  43.5  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1495  LicD family protein  21.98 
 
 		 454 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0746  LicD family protein  23.43 
 
 		 539 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0820  hypothetical protein  23.23 
 
 		 291 aa  42  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5030  hypothetical protein  23.87 
 
 		 424 aa  42.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1186  LICD Protein Family  38.1 
 
 		 384 aa  42  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>