More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0440 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0440  lactoylglutathione lyase  100 
 
 
126 aa  256  8e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0449  lactoylglutathione lyase  98.41 
 
 
126 aa  253  6e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00132524  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1491  glyoxalase I/lactoylglutathione lyase  60.8 
 
 
131 aa  156  7e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.111293  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0364  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.16 
 
 
126 aa  149  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.276612  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1478  lactoylglutathione lyase  58.54 
 
 
130 aa  149  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0459895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0506  lactoylglutathione lyase-like protein  48.8 
 
 
126 aa  136  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002900  lactoylglutathione lyase  48.41 
 
 
131 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.796352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4478  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.46 
 
 
132 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.613578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4804  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.62 
 
 
131 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.114931  normal  0.177904 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03060  hypothetical protein  47.62 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3968  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.62 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.477474  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4287  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.83 
 
 
131 aa  114  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4708  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.44 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148195  normal  0.0502587 
 
 
-
 
NC_004310  BR0056  glyoxalase family protein  45.24 
 
 
131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  48.8 
 
 
128 aa  110  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5815  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.65 
 
 
131 aa  110  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  47.2 
 
 
128 aa  110  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0141  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.44 
 
 
131 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0524  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.65 
 
 
133 aa  110  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27731  lactoylglutathione lyase  46.51 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4654  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.03 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2242  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.24 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3968  hypothetical protein  41.27 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.65 
 
 
131 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0056  glyoxalase family protein  44.44 
 
 
131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.471593  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5251  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.06 
 
 
131 aa  107  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  47.2 
 
 
129 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  46.4 
 
 
129 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  46.09 
 
 
128 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3974  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.06 
 
 
131 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  46.4 
 
 
129 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  46.4 
 
 
129 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0062  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.27 
 
 
131 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.799398  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1399  putative lactoylglutathione lyase  42.52 
 
 
132 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  46.88 
 
 
128 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1990  lactoylglutathione lyase  42.86 
 
 
163 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323356  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  46.4 
 
 
129 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0681  lactoylglutathione lyase  45.31 
 
 
128 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.553347  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  43.65 
 
 
143 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2044  lactoylglutathione lyase  44.53 
 
 
136 aa  105  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2070  hypothetical protein  45.31 
 
 
131 aa  104  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765991  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2724  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.16 
 
 
132 aa  104  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  43.65 
 
 
143 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  43.75 
 
 
130 aa  104  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3237  lactoylglutathione lyase  41.27 
 
 
131 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  45.31 
 
 
137 aa  104  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  45.6 
 
 
129 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  45.6 
 
 
238 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  45.6 
 
 
129 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  45.6 
 
 
129 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  45.6 
 
 
129 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  45.6 
 
 
129 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  45.6 
 
 
129 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4951  lactoylglutathione lyase  44.96 
 
 
135 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3204  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.65 
 
 
131 aa  103  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.107987 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2101  lactoylglutathione lyase  44.53 
 
 
165 aa  103  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0339497  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0139  glyoxalase I  44.44 
 
 
145 aa  103  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00128753  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2232  lactoylglutathione lyase  43.75 
 
 
136 aa  103  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00348977  normal  0.524619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3368  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.31 
 
 
135 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.278611  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1867  lactoylglutathione lyase  43.75 
 
 
136 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0466217  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  43.75 
 
 
128 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0402  lactoylglutathione lyase  44.53 
 
 
135 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69151  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0566  lactoylglutathione lyase  44.53 
 
 
135 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  41.41 
 
 
136 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2107  lactoylglutathione lyase  43.75 
 
 
136 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201436  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1837  lactoylglutathione lyase  41.41 
 
 
136 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429943  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2073  lactoylglutathione lyase  42.19 
 
 
136 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3491  lactoylglutathione lyase  42.86 
 
 
142 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2104  lactoylglutathione lyase  44.53 
 
 
136 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00629536  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2057  lactoylglutathione lyase  44.53 
 
 
136 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000866783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2281  lactoylglutathione lyase  44.53 
 
 
136 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00527881  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1202  lactoylglutathione lyase  46.83 
 
 
144 aa  100  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  41.41 
 
 
135 aa  100  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55130  lactoylglutathione lyase  41.6 
 
 
131 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.39349e-16 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2200  lactoylglutathione lyase  41.41 
 
 
135 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.351573  hitchhiker  0.00000414723 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  41.41 
 
 
135 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  43.31 
 
 
127 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2475  glyoxalase I  43.41 
 
 
132 aa  99  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505304  normal  0.0351257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2413  response regulator receiver domain-containing protein  41.13 
 
 
127 aa  98.6  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2709  lactoylglutathione lyase  41.27 
 
 
127 aa  99  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  41.41 
 
 
135 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0359  lactoylglutathione lyase  46.77 
 
 
129 aa  98.2  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135613  normal  0.0743558 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2094  glyoxalase I  47.2 
 
 
127 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2733  lactoylglutathione lyase  47.2 
 
 
127 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2706  lactoylglutathione lyase  47.2 
 
 
127 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2269  lactoylglutathione lyase  43.75 
 
 
136 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151296  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1688  lactoylglutathione lyase  42.19 
 
 
135 aa  98.2  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.900233  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  42.19 
 
 
129 aa  97.8  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4555  hypothetical protein  43.75 
 
 
136 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2179  lactoylglutathione lyase  40.16 
 
 
136 aa  97.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  41.86 
 
 
158 aa  97.4  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  41.86 
 
 
146 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  42.64 
 
 
138 aa  97.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1387  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.41 
 
 
131 aa  97.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.94622  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2289  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.48 
 
 
131 aa  97.4  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.713044  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2567  lactoylglutathione lyase  41.41 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000056884  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1760  lactoylglutathione lyase  41.41 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  42.19 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0502  lactoylglutathione lyase (glyoxalase I)  42.19 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1869  lactoylglutathione lyase  41.41 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>