More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0377 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0383  L-aspartate oxidase  96.98 
 
 
439 aa  841    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0377  L-aspartate oxidase  100 
 
 
431 aa  865    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  48.35 
 
 
532 aa  363  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  46.67 
 
 
534 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  46.11 
 
 
502 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  46.79 
 
 
538 aa  335  7e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  43.29 
 
 
533 aa  322  7e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  44.42 
 
 
523 aa  318  7.999999999999999e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  42.79 
 
 
541 aa  318  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  42.51 
 
 
531 aa  316  5e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  40.18 
 
 
507 aa  315  9e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  44.04 
 
 
525 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  38.07 
 
 
550 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  40.19 
 
 
533 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  46.21 
 
 
542 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  41.87 
 
 
528 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  41.69 
 
 
531 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  42.46 
 
 
529 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  42.34 
 
 
531 aa  309  5e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  42.13 
 
 
556 aa  309  6.999999999999999e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  41.45 
 
 
537 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  43.75 
 
 
531 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  42.01 
 
 
571 aa  308  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3031  L-aspartate oxidase  41.61 
 
 
536 aa  307  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  42.82 
 
 
539 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  42.54 
 
 
560 aa  306  6e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  39.74 
 
 
531 aa  305  8.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  42.93 
 
 
529 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4056  L-aspartate oxidase  41.98 
 
 
507 aa  305  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.916074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  44.5 
 
 
541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  42.45 
 
 
558 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  42.45 
 
 
557 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  44.07 
 
 
515 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  41.04 
 
 
572 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  42.61 
 
 
535 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  40.72 
 
 
531 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  41.65 
 
 
532 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  41.01 
 
 
532 aa  303  5.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  39.16 
 
 
565 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  42.18 
 
 
534 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  41.46 
 
 
542 aa  302  7.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  44.39 
 
 
515 aa  302  8.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3840  L-aspartate oxidase  41.49 
 
 
529 aa  302  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  40.59 
 
 
541 aa  301  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  41.87 
 
 
538 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  41.87 
 
 
538 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  38.72 
 
 
532 aa  300  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  42.19 
 
 
529 aa  300  3e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4734  L-aspartate oxidase  39.95 
 
 
526 aa  300  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.734093  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  43.69 
 
 
532 aa  300  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  42.23 
 
 
525 aa  299  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  41.13 
 
 
532 aa  299  8e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  42.64 
 
 
532 aa  299  8e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  41.96 
 
 
528 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  40.24 
 
 
538 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  40.29 
 
 
522 aa  297  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  40.59 
 
 
546 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  40.75 
 
 
847 aa  295  8e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4514  L-aspartate oxidase  40.16 
 
 
527 aa  295  8e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712637  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  41.73 
 
 
535 aa  295  9e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  39.8 
 
 
531 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  38.5 
 
 
552 aa  295  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  41.27 
 
 
539 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  43.23 
 
 
609 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  43.43 
 
 
532 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  40.05 
 
 
531 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  41.73 
 
 
535 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  39.55 
 
 
531 aa  293  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  40.77 
 
 
545 aa  293  4e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  41.48 
 
 
535 aa  293  6e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  40 
 
 
538 aa  292  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2849  L-aspartate oxidase  39.07 
 
 
535 aa  292  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  43.43 
 
 
532 aa  292  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  43.49 
 
 
538 aa  292  8e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  38.53 
 
 
577 aa  292  9e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  40.1 
 
 
863 aa  292  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  39.7 
 
 
534 aa  292  9e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 
533 aa  292  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  39.19 
 
 
555 aa  292  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  42.96 
 
 
528 aa  291  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  39.6 
 
 
545 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  39.8 
 
 
552 aa  291  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1080  L-aspartate oxidase  41.24 
 
 
528 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  39.51 
 
 
543 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  37.95 
 
 
557 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  39.45 
 
 
533 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  39.02 
 
 
534 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  41.16 
 
 
542 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  39.45 
 
 
566 aa  290  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0410  L-aspartate oxidase  39.33 
 
 
532 aa  290  4e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.632554  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  36.9 
 
 
530 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  39.02 
 
 
534 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  41.15 
 
 
538 aa  289  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01131  L-aspartate oxidase  38.37 
 
 
562 aa  288  9e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  39.9 
 
 
534 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  42.11 
 
 
535 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  42.11 
 
 
533 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0791  L-aspartate oxidase  43.15 
 
 
528 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357674  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  38.54 
 
 
598 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02181  L-aspartate oxidase  39.37 
 
 
556 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>