More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0376 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  100 
 
 
301 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  98.34 
 
 
301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  50.17 
 
 
304 aa  320  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  50.68 
 
 
304 aa  319  3.9999999999999996e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  50.67 
 
 
303 aa  315  8e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.16 
 
 
303 aa  310  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  47.46 
 
 
304 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.18 
 
 
307 aa  300  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.7 
 
 
303 aa  299  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.1 
 
 
301 aa  298  6e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.16 
 
 
298 aa  296  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  46.6 
 
 
304 aa  294  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  49.01 
 
 
307 aa  292  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  46.44 
 
 
305 aa  291  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  47.18 
 
 
303 aa  290  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.67 
 
 
324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  45.92 
 
 
304 aa  286  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  47.12 
 
 
306 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  44.52 
 
 
322 aa  285  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  47.96 
 
 
306 aa  285  8e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  49.16 
 
 
308 aa  285  9e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  46.28 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  45.42 
 
 
304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  46.26 
 
 
304 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  45.92 
 
 
304 aa  281  9e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.78 
 
 
302 aa  280  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  45.36 
 
 
323 aa  280  2e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.07 
 
 
308 aa  280  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  45.45 
 
 
348 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.52 
 
 
330 aa  279  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  46.58 
 
 
304 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  44.03 
 
 
310 aa  277  2e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.19 
 
 
334 aa  277  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.16 
 
 
331 aa  275  7e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  45.87 
 
 
329 aa  275  8e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  43.92 
 
 
319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  44.22 
 
 
304 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0089  quinolinate synthetase  44.88 
 
 
332 aa  272  6e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  43.77 
 
 
302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0379  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.56 
 
 
298 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  45.3 
 
 
328 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  45.08 
 
 
306 aa  268  1e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  40.54 
 
 
334 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  44.78 
 
 
302 aa  267  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  42 
 
 
334 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  40.2 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  40.2 
 
 
334 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  44.82 
 
 
311 aa  265  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  46.74 
 
 
304 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  47.08 
 
 
304 aa  265  8.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1448  quinolinate synthetase  42.21 
 
 
320 aa  265  8.999999999999999e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  45 
 
 
312 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  41.86 
 
 
321 aa  264  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  42.43 
 
 
322 aa  264  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  42.9 
 
 
324 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.53 
 
 
317 aa  263  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  43.38 
 
 
325 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  43.38 
 
 
325 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  44.37 
 
 
318 aa  263  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  42.52 
 
 
333 aa  262  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  43.52 
 
 
323 aa  262  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  43.43 
 
 
302 aa  262  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.72 
 
 
322 aa  261  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  46.69 
 
 
304 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  44.3 
 
 
328 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0868  quinolinate synthetase  44.63 
 
 
324 aa  259  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.38 
 
 
332 aa  259  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.61 
 
 
306 aa  258  6e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  42.81 
 
 
323 aa  258  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  42.72 
 
 
323 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.57 
 
 
304 aa  255  7e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.69 
 
 
338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.22 
 
 
329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  41.91 
 
 
320 aa  252  4.0000000000000004e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  44.48 
 
 
304 aa  251  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0036  quinolinate synthetase  43.09 
 
 
314 aa  251  1e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.529941  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.74 
 
 
310 aa  249  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2150  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.07 
 
 
311 aa  247  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.484842  normal  0.0905755 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0969  quinolinate synthetase  43.91 
 
 
315 aa  247  2e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.814185  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2202  quinolinate synthetase  43.14 
 
 
330 aa  246  3e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.189573  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  43.61 
 
 
308 aa  243  3e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0015  quinolinate synthetase  42.3 
 
 
313 aa  242  6e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11610  quinolinate synthetase  37.79 
 
 
349 aa  236  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.681965  normal  0.363525 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  40.85 
 
 
318 aa  236  3e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3619  quinolinate synthetase  38.64 
 
 
347 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170829  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2010  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.26 
 
 
349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.701511  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0785  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.73 
 
 
347 aa  233  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2798  quinolinate synthetase  38.44 
 
 
347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5730  quinolinate synthetase  37.94 
 
 
339 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3085  quinolinate synthetase  37.46 
 
 
337 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3068  quinolinate synthetase  37.46 
 
 
337 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.736779  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1185  quinolinate synthetase  42.62 
 
 
298 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3128  quinolinate synthetase  37.46 
 
 
337 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  37.54 
 
 
357 aa  231  9e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0361  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.93 
 
 
295 aa  231  9e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1147  quinolinate synthetase  42.62 
 
 
298 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4432  quinolinate synthetase  39.18 
 
 
350 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558643  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10830  quinolinate synthetase  38.51 
 
 
335 aa  230  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324254  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.1 
 
 
346 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  40.26 
 
 
332 aa  230  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>