More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0348 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  98.46 
 
 		 455 aa  913    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  100 
 
 		 455 aa  924    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  56.04 
 
 		 453 aa  531  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  54.28 
 
 		 454 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  54.19 
 
 		 459 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  52.78 
 
 		 457 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  51.67 
 
 		 460 aa  480  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  51.88 
 
 		 458 aa  479  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  51.43 
 
 		 458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  51.21 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  51.21 
 
 		 454 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  50.77 
 
 		 460 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  51.43 
 
 		 458 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  51.21 
 
 		 458 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  51.43 
 
 		 458 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  51.21 
 
 		 458 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  51.21 
 
 		 458 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  51.21 
 
 		 458 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  47.25 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  47.88 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  47.29 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  47.29 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  47.7 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  44.47 
 
 		 459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  44.74 
 
 		 457 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  43.72 
 
 		 459 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  43.99 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  43.99 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  43.79 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  43.57 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  43.99 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  43.99 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  43.99 
 
 		 459 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  43.99 
 
 		 459 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  44.06 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  44.52 
 
 		 451 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  42.31 
 
 		 458 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  39.87 
 
 		 467 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  40.52 
 
 		 460 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  41.23 
 
 		 458 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  39.12 
 
 		 465 aa  348  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  39.82 
 
 		 464 aa  347  2e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  38.33 
 
 		 451 aa  345  8e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  38.85 
 
 		 454 aa  343  4e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  37.89 
 
 		 453 aa  343  4e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  39.64 
 
 		 453 aa  335  7e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  37.47 
 
 		 473 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  40.5 
 
 		 439 aa  331  2e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  38.99 
 
 		 456 aa  330  4e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  38.16 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  40.13 
 
 		 450 aa  325  8.000000000000001e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  38.74 
 
 		 451 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  36.87 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  37.14 
 
 		 572 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0451  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  36.78 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.450901  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  41.78 
 
 		 554 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  36.04 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  35.7 
 
 		 489 aa  303  5.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  38.35 
 
 		 438 aa  302  7.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  37.31 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  35.39 
 
 		 470 aa  292  7e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  34.16 
 
 		 457 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  33.94 
 
 		 493 aa  289  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  34.47 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  35.63 
 
 		 488 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.69 
 
 		 455 aa  283  4.0000000000000003e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  34.1 
 
 		 460 aa  283  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  34.01 
 
 		 460 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  35.73 
 
 		 496 aa  282  8.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.18 
 
 		 485 aa  281  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  33.77 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  39.74 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  33.77 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  36.11 
 
 		 470 aa  277  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  34.19 
 
 		 466 aa  277  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0862  RNA methyltransferase, TrmA family  38.29 
 
 		 472 aa  276  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0053  RNA methyltransferase, TrmA family  36.71 
 
 		 415 aa  276  7e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  37.3 
 
 		 446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  36.28 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  34.22 
 
 		 476 aa  273  6e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  34.17 
 
 		 485 aa  272  7e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  34.74 
 
 		 468 aa  271  1e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  35.31 
 
 		 495 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  33.11 
 
 		 478 aa  269  7e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  34.07 
 
 		 479 aa  268  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  33.56 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2487  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  35.29 
 
 		 513 aa  268  2e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0134453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  32.53 
 
 		 449 aa  266  5e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  33.05 
 
 		 462 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  32.19 
 
 		 477 aa  262  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  34.73 
 
 		 462 aa  261  1e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  33.56 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  33.84 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0571  RNA methyltransferase, TrmA family  36.88 
 
 		 473 aa  260  3e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  33.62 
 
 		 457 aa  260  3e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  35.83 
 
 		 493 aa  259  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  32.31 
 
 		 480 aa  259  7e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 465 aa  258  1e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  34.19 
 
 		 481 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  34.09 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>