More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0325 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  98.26 
 
 		 461 aa  926    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  100 
 
 		 461 aa  936    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.52 
 
 		 459 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.73 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.16 
 
 		 462 aa  477  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.95 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.41 
 
 		 462 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  48.13 
 
 		 462 aa  422  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  45.91 
 
 		 464 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  45.16 
 
 		 464 aa  398  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000862  putative TldD protein  44.97 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06837  peptidase  45.24 
 
 		 474 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.06 
 
 		 483 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  41 
 
 		 467 aa  360  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.99 
 
 		 475 aa  348  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.26 
 
 		 497 aa  346  6e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.22 
 
 		 460 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.39 
 
 		 460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.7 
 
 		 460 aa  340  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.13 
 
 		 476 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  41.16 
 
 		 460 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  40.43 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  40.26 
 
 		 475 aa  331  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.7 
 
 		 470 aa  329  8e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.17 
 
 		 464 aa  327  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40 
 
 		 462 aa  324  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.09 
 
 		 462 aa  319  6e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.28 
 
 		 459 aa  317  3e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.77 
 
 		 469 aa  315  9e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  38.49 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0364  putative modulator of DNA gyrase; TldD  38.74 
 
 		 469 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.33 
 
 		 486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  38.7 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10461  putative modulator of DNA gyrase; TldD  38.41 
 
 		 469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157688  hitchhiker  0.0011828 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.74 
 
 		 488 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  hitchhiker  0.00000000738048 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  37.8 
 
 		 491 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09191  putative modulator of DNA gyrase; TldD  38.03 
 
 		 474 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.507824  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2763  microcin-processing peptidase 2  37.01 
 
 		 490 aa  299  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.89 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14421  putative modulator of DNA gyrase; TldD  37.31 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0957  putative modulator of DNA gyrase; TldD  37.99 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.405602  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.8 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1476  DNA gyrase modulator peptidase U62  35.89 
 
 		 490 aa  295  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  36.91 
 
 		 481 aa  294  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3429  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.55 
 
 		 489 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2687  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.55 
 
 		 489 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  38.36 
 
 		 481 aa  293  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.44 
 
 		 480 aa  293  6e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  36.21 
 
 		 483 aa  292  7e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.88 
 
 		 496 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  37.55 
 
 		 486 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.99 
 
 		 479 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  38.06 
 
 		 470 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  37.34 
 
 		 498 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1496  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.66 
 
 		 496 aa  290  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.768084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10261  putative modulator of DNA gyrase; TldD  37.58 
 
 		 474 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.15 
 
 		 477 aa  289  6e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  37.07 
 
 		 479 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  38.06 
 
 		 470 aa  289  7e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  36.05 
 
 		 481 aa  289  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09221  putative modulator of DNA gyrase; TldD  36.82 
 
 		 481 aa  289  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227286 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  37.04 
 
 		 497 aa  289  8e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  37.53 
 
 		 497 aa  289  9e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  36.89 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.89 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  36.89 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  36.89 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  36.89 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  36.15 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  36.89 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1166  putative modulator of DNA gyrase; TldD  35.79 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.564815  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  36.89 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.15 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.88 
 
 		 479 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10251  putative modulator of DNA gyrase; TldD  38.13 
 
 		 474 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334911  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.03 
 
 		 488 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  37.5 
 
 		 497 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  36.89 
 
 		 481 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.85 
 
 		 479 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  36.89 
 
 		 481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  36.97 
 
 		 481 aa  287  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.86 
 
 		 488 aa  287  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.19 
 
 		 490 aa  287  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1127  microcin-processing peptidase 2  37.09 
 
 		 489 aa  286  5e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  37.64 
 
 		 488 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  36.34 
 
 		 486 aa  286  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.91 
 
 		 486 aa  285  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  35.11 
 
 		 482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.56 
 
 		 508 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.71 
 
 		 486 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0850  microcin-processing peptidase 2  35.36 
 
 		 486 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.87 
 
 		 493 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  37.2 
 
 		 471 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.62 
 
 		 480 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4091  tldD protein  37.08 
 
 		 482 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1093  microcin-processing peptidase 2  36.13 
 
 		 493 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.21 
 
 		 482 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.92 
 
 		 496 aa  283  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.98 
 
 		 491 aa  283  6.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.7 
 
 		 480 aa  283  7.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>