More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0310 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  100 
 
 		 207 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  98.55 
 
 		 207 aa  394  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0884  DedA family protein  40.78 
 
 		 208 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0866  DedA family protein  40.78 
 
 		 208 aa  138  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000043469  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  38.05 
 
 		 214 aa  130  9e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  35 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  37.13 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  31.84 
 
 		 202 aa  121  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  33.99 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  33.5 
 
 		 200 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  33.5 
 
 		 200 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  33.5 
 
 		 200 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  33.5 
 
 		 200 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  34.13 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.65 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.75 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  32.51 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  31.79 
 
 		 218 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  31.79 
 
 		 218 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  32 
 
 		 211 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  33 
 
 		 200 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  36.14 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  33.5 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  32.51 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  33.52 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  31.28 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0884  SNARE associated Golgi protein  39.6 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.141066  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  28.85 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  34.36 
 
 		 200 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.14 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.33 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  32.64 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  36.5 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  29.52 
 
 		 216 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  33.98 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  36.17 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  31.03 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  33.85 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  31.55 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  32.83 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  33 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2468  SNARE associated Golgi protein  35.03 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.663363  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  34.63 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  32.14 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  34.15 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  34.63 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  30.24 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  29.08 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  38.41 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  32.83 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  34.15 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  34.15 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  33.66 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  33.66 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  33.66 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  33 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  33 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  31.82 
 
 		 201 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  32.26 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  31.44 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  28.37 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1744  DedA family membrane protein  37.58 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0059834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1475  dedA protein  37.58 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.937039  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  33.52 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  34.55 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.87 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.68 
 
 		 202 aa  101  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.34 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  31.41 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  34.83 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  34.11 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  33.53 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  30.3 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.77 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  35.15 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  28.86 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  33.69 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  28.71 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  29 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.77 
 
 		 241 aa  95.5  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  26.79 
 
 		 216 aa  94.7  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  29.38 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  28.14 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  29.53 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0457  DedA family protein  36.43 
 
 		 169 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00277812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0447  DedA family protein  38.3 
 
 		 169 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.364364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  28.86 
 
 		 198 aa  93.2  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  28.8 
 
 		 248 aa  92.8  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  27.32 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  31.03 
 
 		 325 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  30.15 
 
 		 203 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  32.62 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  30.15 
 
 		 203 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  29.38 
 
 		 202 aa  92.4  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  31.53 
 
 		 266 aa  92.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.92 
 
 		 224 aa  91.7  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  28.21 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0984  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.94 
 
 		 203 aa  91.3  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  32.51 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  29.38 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>