More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0260 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  100 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  99.54 
 
 		 217 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  48.39 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0792  beta-phosphoglucomutase  44.28 
 
 		 215 aa  177  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0682  HAD hydrolase, family IA, variant 3  33.68 
 
 		 226 aa  118  6e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01320  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  30.66 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.72 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  32.43 
 
 		 220 aa  101  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.95 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.95 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000345367  normal  0.0902559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  30.52 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.45 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  30.88 
 
 		 232 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  35.79 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  33.16 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.14 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.46 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  26.64 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.54 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00251058  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  32.2 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  30.84 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.7 
 
 		 217 aa  92  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.73 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  31.18 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.01 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  33.67 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  27.57 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.56 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.44 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.19 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  30.69 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35659  predicted protein  28.28 
 
 		 267 aa  89.4  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.79 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  30.48 
 
 		 229 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  30.81 
 
 		 454 aa  89.4  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0990  HAD family hydrolase  29.08 
 
 		 253 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.480228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0953  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.08 
 
 		 253 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.7 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  34.21 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.8 
 
 		 253 aa  89  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  29.12 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.49 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  30.65 
 
 		 271 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.11 
 
 		 218 aa  88.2  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 221 aa  88.2  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  27.41 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  29.52 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.17 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  33.68 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.1 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.4 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  33.67 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  33.67 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.83 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.32 
 
 		 227 aa  86.3  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  32.49 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  33.67 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.41 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.07 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.06 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.96 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.73 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27350  HAD-superfamily hydrolase  31.4 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 256 aa  85.1  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1717  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.88 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.04 
 
 		 254 aa  85.1  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  33.16 
 
 		 207 aa  84.7  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  28.17 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.6 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  27.64 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  33.16 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.33 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.75 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.95 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.65 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  29.1 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  29.23 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.47 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.32 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1034  hydrolase  28.64 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  27.49 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  28.26 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  30.37 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.47 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  25 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.81 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.305682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1905  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.81 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.798501  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  32.46 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1947  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.81 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1824  HAD family hydrolase  28.31 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  30.6 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2445  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.81 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2125  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.27 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0177126  hitchhiker  0.00144451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>