More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0255 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  98.72 
 
 		 390 aa  773    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  100 
 
 		 390 aa  781    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  52.16 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.16 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  43.03 
 
 		 415 aa  310  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  60.17 
 
 		 711 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  50 
 
 		 493 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  51.67 
 
 		 443 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  48.52 
 
 		 424 aa  262  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  50.19 
 
 		 468 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  38.62 
 
 		 450 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  36.92 
 
 		 409 aa  260  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  54.24 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  37.08 
 
 		 407 aa  260  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  53.78 
 
 		 429 aa  260  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  51.28 
 
 		 816 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  48.19 
 
 		 424 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  51.45 
 
 		 464 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  50 
 
 		 870 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  50.61 
 
 		 488 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  49.57 
 
 		 410 aa  252  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  46.15 
 
 		 447 aa  253  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  50 
 
 		 472 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  49.36 
 
 		 456 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  46.28 
 
 		 435 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  44.68 
 
 		 440 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  48.75 
 
 		 472 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  48.97 
 
 		 455 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  51.44 
 
 		 448 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  52.78 
 
 		 428 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  47.67 
 
 		 549 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  47.92 
 
 		 436 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  45.63 
 
 		 427 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  46.69 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  43.88 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  48.93 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  49.6 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.37 
 
 		 454 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  49.36 
 
 		 498 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  46.56 
 
 		 421 aa  242  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  34.15 
 
 		 408 aa  242  7e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  38.51 
 
 		 432 aa  242  7.999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  48.98 
 
 		 427 aa  242  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  46.27 
 
 		 437 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  46.61 
 
 		 416 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  46.82 
 
 		 418 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  48.78 
 
 		 449 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  52.25 
 
 		 428 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  45.79 
 
 		 420 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  33.33 
 
 		 400 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.5 
 
 		 415 aa  238  9e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  44.94 
 
 		 254 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.77 
 
 		 469 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.77 
 
 		 465 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.77 
 
 		 465 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  53.17 
 
 		 422 aa  236  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.77 
 
 		 471 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.77 
 
 		 465 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.77 
 
 		 465 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.77 
 
 		 465 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  44.79 
 
 		 435 aa  236  7e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  49.77 
 
 		 369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.37 
 
 		 469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  44.4 
 
 		 427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  42.18 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  45.17 
 
 		 439 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  47.66 
 
 		 405 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  40.36 
 
 		 429 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  50.72 
 
 		 411 aa  233  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.36 
 
 		 417 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  46.84 
 
 		 392 aa  232  9e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  48.94 
 
 		 394 aa  232  9e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  49.16 
 
 		 242 aa  232  1e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  48.09 
 
 		 649 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  37.57 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  50.9 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  46.06 
 
 		 250 aa  229  9e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5118  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  45.17 
 
 		 549 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  43.39 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5510  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  45.17 
 
 		 549 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0796349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5360  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  45.17 
 
 		 549 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  42.26 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  35.9 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  46.52 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  47.32 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  44.49 
 
 		 416 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  43.07 
 
 		 431 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  48.44 
 
 		 478 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  43.98 
 
 		 246 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  42.91 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  43.08 
 
 		 429 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  45.92 
 
 		 424 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  42.06 
 
 		 254 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  42.06 
 
 		 254 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  40.22 
 
 		 424 aa  226  7e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  42.45 
 
 		 422 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 422 aa  225  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  45.28 
 
 		 420 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  47.93 
 
 		 418 aa  225  9e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>