219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0193 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0193  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00253275  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0195  hypothetical protein  96.63 
 
 
89 aa  171  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165888  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0988  protein of unknown function DUF156  53.41 
 
 
91 aa  94  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.11096  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0131  hypothetical protein  50.57 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0714  hypothetical protein  48.81 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00303881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1741  protein of unknown function DUF156  37.65 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0466  protein of unknown function DUF156  38.64 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  39.08 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  42.05 
 
 
87 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  40.96 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  40.96 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1271  protein of unknown function DUF156  47.83 
 
 
88 aa  67  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.858801  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1674  hypothetical protein  42.11 
 
 
97 aa  67  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.184479  hitchhiker  0.000845863 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  40.96 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  39.76 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  39.76 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  39.76 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  39.76 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  39.76 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  39.76 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  39.76 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10985  hypothetical protein  32.53 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0616995  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0132  hypothetical protein  36.84 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  37.8 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  38.55 
 
 
100 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2278  hypothetical protein  32.56 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  38.16 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  35.53 
 
 
91 aa  62  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  36.84 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  36 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3411  protein of unknown function DUF156  37.21 
 
 
91 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0125991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36760  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  61.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3585  protein of unknown function DUF156  36.47 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000231569  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0130  protein of unknown function DUF156  37.97 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  35.29 
 
 
95 aa  60.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4267  hypothetical protein  37.65 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  41.33 
 
 
103 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  41.33 
 
 
103 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  60.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  34.21 
 
 
91 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  34.83 
 
 
103 aa  60.1  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0120  hypothetical protein  34.21 
 
 
91 aa  60.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  40 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  36.84 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  34.21 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  37.35 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0533  hypothetical protein  34.83 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0395944  normal  0.0381301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  37.35 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  36.84 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  35.53 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4499  hypothetical protein  34.88 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.519747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3257  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0391  hypothetical protein  33.72 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0295  hypothetical protein  35.44 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0676  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0115732  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4549  protein of unknown function DUF156  35.71 
 
 
98 aa  57.8  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4465  hypothetical protein  36.05 
 
 
109 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4548  hypothetical protein  36.05 
 
 
109 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  35.29 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2536  protein of unknown function DUF156  29.89 
 
 
100 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157002  normal  0.182354 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  30.23 
 
 
101 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2514  hypothetical protein  37.5 
 
 
86 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.193584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1475  hypothetical protein  35.44 
 
 
88 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000574434  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4045  hypothetical protein  35.06 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3133  protein of unknown function DUF156  35.44 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0036  hypothetical protein  37.5 
 
 
86 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  32.47 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0036  hypothetical protein  37.5 
 
 
86 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1739  protein of unknown function DUF156  37.21 
 
 
103 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0478748  hitchhiker  0.00498764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1454  hypothetical protein  36.05 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10580  hypothetical protein  31.4 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0042499  normal  0.482533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2921  hypothetical protein  32.47 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.719524  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1472  hypothetical protein  36.05 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0673  hypothetical protein  32.47 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121389  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  31.52 
 
 
115 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  33.73 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5648  protein of unknown function DUF156  29.89 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4587  hypothetical protein  29.89 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19810  hypothetical protein  32.56 
 
 
119 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.418046  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3243  hypothetical protein  37.8 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1211  hypothetical protein  35.63 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.364409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1531  hypothetical protein  31.58 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3728  protein of unknown function DUF156  36.11 
 
 
111 aa  53.9  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00718584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2171  protein of unknown function DUF156  30.43 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2051  protein of unknown function DUF156  30.43 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.44014e-26 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9134  hypothetical protein  29.89 
 
 
93 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3638  hypothetical protein  30.11 
 
 
96 aa  53.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4242  protein of unknown function DUF156  34.88 
 
 
115 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0784  protein of unknown function DUF156  31.03 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.63261  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3871  protein of unknown function DUF156  30.43 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00362908 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3602  protein of unknown function DUF156  33.75 
 
 
100 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.251846  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2597  protein of unknown function DUF156  34.88 
 
 
109 aa  52  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0918  protein of unknown function DUF156  36.47 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0914  hypothetical protein  42.62 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  30 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>