More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0189 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  100 
 
 
399 aa  801  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  98.5 
 
 
399 aa  793  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  39.78 
 
 
441 aa  304  2e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  40.36 
 
 
431 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  30.75 
 
 
402 aa  201  2e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  33.33 
 
 
379 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  32.75 
 
 
375 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  31.94 
 
 
377 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  32.09 
 
 
376 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.73675e-08  hitchhiker  4.27958e-09 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  33.5 
 
 
375 aa  186  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.19165e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  30.54 
 
 
379 aa  186  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  27.71 
 
 
411 aa  183  4e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  31.69 
 
 
377 aa  182  9e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  29.32 
 
 
372 aa  179  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  30.36 
 
 
400 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  31.23 
 
 
379 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  31.82 
 
 
373 aa  173  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  29.97 
 
 
374 aa  164  2e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.67566e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  30.5 
 
 
412 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.81252e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  28.85 
 
 
374 aa  162  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  28.53 
 
 
404 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  42.65 
 
 
541 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  27.7 
 
 
404 aa  155  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  33.33 
 
 
375 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  1.52343e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  28.75 
 
 
432 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  28.3 
 
 
398 aa  142  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.18753e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  52.42 
 
 
472 aa  142  1e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  50 
 
 
490 aa  140  5e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  39.89 
 
 
309 aa  139  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.49073e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  29.35 
 
 
396 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.44038e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  43.1 
 
 
328 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  52.46 
 
 
290 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  43.9 
 
 
238 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  28.47 
 
 
397 aa  137  3e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  27.64 
 
 
397 aa  137  3e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  30.5 
 
 
404 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  5.21707e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  51.64 
 
 
316 aa  137  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  27.85 
 
 
391 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  47.58 
 
 
471 aa  136  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  51.2 
 
 
538 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  46.77 
 
 
471 aa  134  2e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  31.64 
 
 
330 aa  134  2e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  41.04 
 
 
327 aa  134  4e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  40.78 
 
 
305 aa  133  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  36.84 
 
 
317 aa  133  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  48.8 
 
 
430 aa  132  8e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  49.18 
 
 
621 aa  132  1e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  33.48 
 
 
305 aa  132  1e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  4.62301e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  25.57 
 
 
387 aa  132  1e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  48.41 
 
 
470 aa  131  2e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1152  peptidase M23B  28.5 
 
 
414 aa  131  2e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.91008e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  48.36 
 
 
527 aa  131  2e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  33.91 
 
 
319 aa  131  2e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  47.9 
 
 
460 aa  131  2e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  51.22 
 
 
318 aa  131  2e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  1.08635e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  52.17 
 
 
288 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  4.16895e-06  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  41.95 
 
 
468 aa  131  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  46.15 
 
 
646 aa  130  4e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  39.77 
 
 
482 aa  130  4e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  43.95 
 
 
692 aa  130  4e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  52.03 
 
 
216 aa  130  4e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  51.28 
 
 
392 aa  130  5e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  42.59 
 
 
332 aa  130  5e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  47.54 
 
 
615 aa  130  5e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  49.62 
 
 
414 aa  130  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  30.45 
 
 
394 aa  129  8e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1270  peptidase M23B  23.48 
 
 
419 aa  129  8e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  55.12 
 
 
287 aa  129  9e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  44.26 
 
 
464 aa  129  1e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  42.38 
 
 
464 aa  128  1e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.31 
 
 
321 aa  128  1e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  37.08 
 
 
569 aa  129  1e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  45.8 
 
 
524 aa  129  1e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  43.71 
 
 
498 aa  128  2e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  50.43 
 
 
443 aa  128  2e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  49.22 
 
 
323 aa  128  2e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  47.9 
 
 
465 aa  128  2e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  50.83 
 
 
282 aa  128  2e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  45.53 
 
 
314 aa  128  2e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  52.59 
 
 
391 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  45.16 
 
 
288 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  49.58 
 
 
457 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  47.01 
 
 
343 aa  127  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  51.28 
 
 
392 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  46.62 
 
 
690 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  48 
 
 
271 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  25.24 
 
 
477 aa  127  4e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  45.97 
 
 
229 aa  127  4e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  46.34 
 
 
367 aa  127  4e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  50 
 
 
454 aa  127  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  31.56 
 
 
300 aa  126  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  34.1 
 
 
301 aa  126  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  37.89 
 
 
341 aa  126  8e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  45.9 
 
 
423 aa  126  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  46.72 
 
 
442 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  51.79 
 
 
238 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  47.58 
 
 
470 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  44.63 
 
 
665 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  28.71 
 
 
469 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  47.15 
 
 
287 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>