More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0175 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  100 
 
 		 288 aa  584  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  99.31 
 
 		 288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  71.97 
 
 		 292 aa  434  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  55.4 
 
 		 293 aa  341  7e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  55.4 
 
 		 293 aa  341  7e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  50.52 
 
 		 295 aa  295  5e-79  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  45.56 
 
 		 298 aa  269  5e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  37.85 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  37.5 
 
 		 297 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  37.5 
 
 		 297 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  37.5 
 
 		 297 aa  216  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  37.5 
 
 		 297 aa  216  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  37.5 
 
 		 297 aa  216  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  37.5 
 
 		 297 aa  216  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  37.5 
 
 		 297 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  37.5 
 
 		 297 aa  216  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  36.81 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  36.81 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  36.81 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  36.81 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  36.81 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  36.46 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  32.98 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  32.53 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3485  dihydrodipicolinate synthetase  35.02 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  32.42 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0039  N-acetylneuraminate lyase, putative  30.34 
 
 		 305 aa  132  9e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 294 aa  132  9e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  28.37 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.37 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  29.43 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  26.9 
 
 		 371 aa  126  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  34.05 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  28.78 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  28.82 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  28.17 
 
 		 294 aa  125  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  30.97 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.68 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.08 
 
 		 313 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  30.18 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  29.89 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  26.16 
 
 		 294 aa  122  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  34.48 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  26.74 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  31.93 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  28.17 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  31.18 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  25.86 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  27.87 
 
 		 313 aa  119  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.03 
 
 		 313 aa  118  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 292 aa  118  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  32.91 
 
 		 292 aa  118  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  28.83 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  25.89 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1666  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.458011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  27.11 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0999  dihydrodipicolinate synthase  34.8 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  28.99 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0090  Dihydrodipicolinate synthase  30.47 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  29.58 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  28.99 
 
 		 326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  25.89 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3709  dihydrodipicolinate synthetase  26.13 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.646628  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  27.93 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 		 290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3237  dihydrodipicolinate synthase  27.56 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115638  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  26.64 
 
 		 295 aa  115  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  27.43 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 		 290 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  29.35 
 
 		 298 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3538  dihydrodipicolinate synthetase  26.13 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.423247  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  28.21 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3219  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1293  putative N-acetylneuraminate lyase  29.31 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.519377  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  25.18 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2776  putative N-acetylneuraminate lyase  29.31 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1400  dihydrodipicolinate synthetase  29.31 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.13834  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  29.08 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  25.36 
 
 		 296 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  27.87 
 
 		 291 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  26.24 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  25.96 
 
 		 294 aa  112  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 304 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  29.12 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  26.37 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  26.37 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>